Công ty Huỳnh Gia Phúc đã vi phạm các hành vi về bảo vệ môi trường như: không vận hành thường xuyên hoặc vận hành không đúng quy trình đối với công trình xử lý chất thải, xây lắp không đúng quy định công trình xử lý chất thải, chưa thực hiện biện pháp giảm thiểu mùi hôi, không có giấy xác nhận hoàn thành công trình bảo vệ môi trường.
Với các hành vi trên, Công ty Huỳnh Gia Phúc bị xử phạt hành chính gần 600 triệu đồng và buộc đình chỉ hoạt động 6 tháng để khắc phục hậu quả.