Liên quan tới vụ án, tháng 1-2022, Cơ quan Cảnh sát điều tra (Bộ Công an) ra kết luận, đề nghị truy tố 12 bị can, trong đó có ông Trần Hùng (cựu kiểm soát viên chính, cựu Tổ trưởng Tổ 1444 thuộc Tổng cục Quản lý thị trường, Bộ Công thương). Sau khi Viện Kiểm sát nhân dân tối cao trả hồ sơ lần thứ nhất, phía cơ quan điều tra ra kết luận bổ sung, tăng số bị can bị đề nghị truy tố lên 34 người.
Kết luận điều tra cho thấy, năm 2021, Cao Thị Minh Thuận (cựu Giám đốc Công ty Phú Hưng Phát) cùng đồng phạm đặt in, nhập kho hơn 9,3 triệu quyển sách giả các loại liên quan Nhà Xuất bản Giáo Dục. Nhóm này đã tiêu thụ hơn 6,3 triệu quyển; còn 3 triệu quyển chưa kịp bán bị cảnh sát thu giữ. Trong vụ án, do ông Trần Hùng không thừa nhận đã nhận tiền của Thuận nên phía cơ quan điều tra đề nghị xem xét tình tiết tăng nặng của ông Trần Hùng trong quá trình truy tố, xét xử.
