Sau khi Viện Kiểm sát nhân dân tối cao phê chuẩn, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã thực hiện tống đạt Quyết định khởi tố bị can, thi hành Lệnh bắt bị can để tạm giam, khám xét chỗ ở và nơi làm việc đối với bị can Nguyễn Quang Linh.
Trước đó, Ban Bí thư xác định các ông Tô Anh Dũng (Thứ trưởng Bộ Ngoại giao, bị Bộ Công an khởi tố và bắt tạm giam hôm 14-4) và Nguyễn Quang Linh đã lợi dụng vị trí công tác, vi phạm nguyên tắc, quy chế làm việc; vi phạm quy định của Đảng, pháp luật của Nhà nước trong việc tham mưu, trình phê duyệt cấp phép cho doanh nghiệp tổ chức các chuyến bay đưa công dân Việt Nam về nước trong đại dịch Covid-19; vi phạm Quy định về những điều đảng viên không được làm.
Liên quan tới vụ án, Cơ quan An ninh điều tra đã khởi tố bị can, bắt bị can để tạm giam đối với Nguyễn Thanh Hải (sinh năm 1971, trú tại Hà Nội, là Vụ trưởng Vụ Quan hệ quốc tế, Văn phòng Chính phủ) về hành vi Nhận hối lộ, quy định tại Điều 354 Bộ luật Hình sự.
Tại vụ án Cục Lãnh sự (Bộ Ngoại giao) tính đến nay, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã khởi tố, bắt tạm giam 18 bị can; trong đó có 13 bị can bị khởi tố về hành vi Nhận hối lộ, 4 bị can về hành vi Đưa hối lộ và 1 bị can về hành vi Lừa đảo chiếm đoạt tài sản.
Trong số 13 bị can bị khởi tố, bắt tạm giam để điều tra về hành vi Nhận hối lộ, ông Tô Anh Dũng (Thứ trưởng Bộ Ngoại giao) đã bị Cơ quan An ninh điều tra đã khởi tố, bắt tạm giam vào tháng 4-2022. Một số cán bộ của Bộ Ngoại giao cũng bị khởi tố, bắt giam, gồm: bà Nguyễn Thị Hương Lan (Cục trưởng Cục Lãnh sự); ông Đỗ Hoàng Tùng (Phó Cục trưởng Cục Lãnh sự); ông Lê Tuấn Anh (Chánh Văn phòng Cục Lãnh sự) và ông Lưu Tuấn Dũng (Phó phòng Bảo hộ công dân, Cục Lãnh sự).
Cùng bị bắt giữ về hành vi Nhận hối lộ còn có ông Trần Văn Dự (cựu Phó Cục trưởng Cục Quản lý xuất nhập cảnh); Vũ Anh Tuấn và Vũ Sỹ Cường (là cựu cán bộ Cục Quản lý xuất nhập cảnh, Bộ Công an) cùng 2 cán bộ của Văn phòng Chính phủ là bà Nguyễn Mai Anh và ông Nguyễn Tiến Thân (cùng là chuyên viên Vụ Quan hệ quốc tế).
Cơ quan điều tra cũng đã khởi tố, bắt giam Phạm Trung Kiên (chuyên viên Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế thuộc Bộ Y tế) và Ngô Quang Tuấn (chuyên viên Vụ Hợp tác quốc tế, Bộ GTVT) về hành vi Nhận hối lộ.
Liên quan hành vi Đưa hối lộ, Cơ quan An ninh điều tra đã khởi tố, bắt tạm giam 4 người, gồm: Hoàng Diệu Mơ (Tổng Giám đốc Công ty TNHH thương mại du lịch và dịch vụ hàng không An Bình); Nguyễn Thị Tường Vi (Giám đốc Công ty TNHH tư vấn và đầu tư ATA Việt Nam); Nguyễn Thị Dung Hạnh (Giám đốc Công ty TNHH G Việt Nam 19) và Nguyễn Tiến Mạnh (Phó Giám đốc Công ty cổ phần du lịch thương mại Lữ Hành Việt, Giám đốc Công ty vận tải du lịch Hoàng Long Luxury).
Bên cạnh đó, Cơ quan An ninh điều tra còn khởi tố ông Bùi Huy Hoàng (cán bộ Cục Y tế dự phòng, Bộ Y tế), về hành vi Lừa đảo chiếm đoạt tài sản. Theo Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an, qua điều tra cho thấy, các bị can đã nhận hàng chục tỷ đồng và hàng trăm ngàn USD.
Hiện vụ việc đang tiếp tục được điều tra làm rõ.