Theo đó, mở rộng điều tra vụ án xảy ra tại Bộ Ngoại giao; TP Hà Nội và các tỉnh, thành phố; cùng ngày, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã ra các quyết định khởi tố bị can, lệnh bắt bị can để tạm giam, lệnh khám xét chỗ ở và nơi làm việc đối 2 bị can Lê Hồng Sơn (sinh năm 1975, hiện là Tổng Giám đốc Công ty TNHH thương mại dịch vụ và Du lịch Bầu trời xanh - Blue Sky), về tội “Đưa hối lộ”, quy định tại điều 364 Bộ luật hình sự và Phạm Bá Sơn (sinh năm 1983 là lao động tự do) về tội “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản”, quy định tại điều 174 Bộ luật hình sự.
Sau khi Viện Kiểm sát nhân dân tối cao phê chuẩn, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã thực hiện tống đạt quyết định khởi tố bị can, thi hành lệnh bắt bị can để tạm giam, khám xét chỗ ở và nơi làm việc đối với 2 bị can nêu trên.
Tại Bộ Ngoại giao có 5 bị can liên quan, gồm: Thứ trưởng Tô Anh Dũng; Cục trưởng Cục Lãnh sự Nguyễn Thị Hương Lan; Cục phó Đỗ Hoàng Tùng; Chánh Văn phòng Cục Lãnh sự Lê Tuấn Anh và Phó phòng Bảo hộ công dân Lưu Tuấn Dũng.
Bộ GTVT có 1 bị can là Ngô Quang Tuấn, chuyên viên Vụ Hợp tác quốc tế. Bộ Y tế có 2 bị can là Phạm Trung Kiên, chuyên viên Vụ trang thiết bị công trình y tế và Bùi Huy Hoàng, chuyên viên Cục Y tế dự phòng.
Tại Cục Quản lý xuất nhập cảnh của Bộ Công an, 3 bị can bị khởi tố gồm cựu Cục phó Trần Văn Dự, cán bộ Vũ Sỹ Cường và Vũ Anh Tuấn.