Tham dự lễ viếng có: nguyên Chủ tịch nước Trương Tấn Sang; Ủy viên Bộ Chính trị, Thường trực Ban Bí thư Trần Quốc Vượng; Ủy viên Bộ Chính trị, Bí thư Trung ương Đảng, Trưởng ban Tổ chức Trung ương Phạm Minh Chính cùng lãnh đạo, nguyên lãnh đạo Đảng, Nhà nước, TP Hà Nội, các bộ, ngành. Tổng Bí thư Nguyễn Phú Trọng, Thủ tướng Nguyễn Xuân Phúc, nguyên Thủ tướng Nguyễn Tấn Dũng và nhiều lãnh đạo Đảng, Nhà nước đã gửi vòng hoa viếng.
Trong sổ tang, nguyên Chủ tịch nước Trương Tấn Sang xúc động viết: “Giáo sư, Nhà giáo nhân dân Phan Huy Lê, chuyên gia hàng đầu của nền sử học Việt Nam, một tài năng lớn trong giới sử học nước nhà đã ra đi. Xin chia buồn sâu sắc cùng gia quyến Giáo sư! Vĩnh biệt Giáo sư, Nhà giáo nhân dân Phan Huy Lê!”.
Đánh giá về GS-NGND Phan Huy Lê, GS Nguyễn Quang Ngọc (nguyên Viện trưởng Viện Việt Nam học, Đại học Quốc gia Hà Nội) cho rằng ai cũng có thể nhận ra vai trò tiên phong, dẫn dắt về mặt học thuật của GS Phan Huy Lê trong nền sử học nước ta, nhưng sự suy tôn một nhà khoa học lên vị trí cao nhất suốt một nửa thế kỷ cũng là câu chuyện hiếm có.
GS-NGND Phan Huy Lê qua đời vào hồi 13 giờ 6 ngày 23-6 tại Bệnh viện Bạch Mai (Hà Nội), hưởng thọ 84 tuổi, sau một thời gian lâm trọng bệnh. Sau lễ viếng và truy điệu, lễ an táng GS-NGND Phan Huy Lê đã được tổ chức cùng ngày tại Công viên Nghĩa trang Vĩnh Hằng (Hà Nội).
