Vinalines sẽ giảm tỷ lệ sở hữu tại Công ty cổ phần Vận tải biển Việt Nam từ 51% xuống 49%, tương đương giảm 2,8 triệu cổ phần; giảm tỷ lệ sở hữu tại Công ty cổ phần Vận tải biển Vinaship từ 51% xuống 36%, tương đương giảm 3 triệu cổ phần. Vinalines cũng sẽ thoái vốn toàn bộ tại Công ty cổ phần Tín Nghĩa, Công ty cổ phần Hợp tác lao động với nước ngoài và Công ty cổ phần Vận tải biển Hải Âu.
Hiện số lượng doanh nghiệp của Vinalines đã giảm từ 73 doanh nghiệp thời điểm bắt đầu tái cơ cấu (năm 2013) còn 35 doanh nghiệp, bao gồm cả Công ty cổ phần Cảng Quy Nhơn mới được Vinalines tiếp nhận lại từ tháng 6. Tổng số nợ của Vinalines cũng đã giảm tương ứng từ hơn 67.500 tỷ đồng xuống còn hơn 17.100 tỷ đồng. Sau khi thoái vốn, Vinalines chỉ còn tập trung vào các hoạt động khai thác cảng biển, vận tải biển và dịch vụ hàng hải.