Các bị can bị đề nghị truy tố do có sai phạm trong chuyển nhượng khoảng 32ha đất tại xã Phước Kiển (huyện Nhà Bè) và một phần diện tích của dự án khu dân cư ven sông Tân Phong (quận 7) cho Công ty CP Quốc Cường Gia Lai (gọi tắt là Công ty Quốc Cường Gia Lai).
Theo cáo trạng, tháng 11-2000, Công ty TNHH MTV Đầu tư và Xây dựng Tân Thuận (gọi tắt là Công ty Tân Thuận) được giao nhiệm vụ đầu tư xây dựng dự án Phước Kiển (tại xã Phước Kiển). Ban Tài chính Quản trị Thành ủy (nay là Văn phòng Thành ủy TPHCM) cũng chấp thuận chủ trương đầu tư dự án.
Tháng 8-2016, Công ty Quốc Cường Gia Lai đề nghị hợp tác đầu tư với tỷ lệ 75:25 hoặc xin nhận chuyển nhượng 100% dự án Phước Kiển.
Ông Trần Công Thiện, Tổng Giám đốc Công ty Tân Thuận, chỉ đạo ông Nguyễn Xuân Tùng, Trưởng Phòng Kinh tế tổng hợp, thuê Công ty TNHH Kiểm toán và Dịch vụ tin học TPHCM ban hành chứng thư thẩm định giá xác định diện tích 32ha đất tại dự án Phước Kiển với giá 1,05 triệu đồng/m2. Sau đó, Công ty Tân Thuận căn cứ vào giá này làm đơn giá tối thiểu thương thảo hợp tác.
Ngày 5-6-2017, Công ty Tân Thuận ký hợp đồng chuyển nhượng quyền sử dụng 32ha đất ở Phước Kiển cho Công ty Quốc Cường Gia Lai (do bà Nguyễn Thị Như Loan làm đại diện) với giá 1,29 triệu đồng/m2. Công ty Tân Thuận nhận của Công ty Quốc Cường Gia Lai 374 tỷ đồng và 23 tỷ đồng tiền thuế VAT.
Sau đó, hợp đồng bị hủy, Công ty Tân Thuận trả lại cho Công ty Quốc Cường Gia Lai 374 tỷ đồng, 23 tỷ đồng tiền thuế tiền thuế VAT và 21 tỷ đồng tiễn lãi. Vụ việc được xác định gây thiệt hại cho nhà nước hơn 202 tỷ đồng.
Ngoài ra, Công ty Tân Thuận cũng chuyển nhượng gần 33.000m2 đất thuộc dự án ven sông tại phường Tân Phong cho Công ty Quốc Cường Gia Lai với giá 20 triệu đồng/m2. Việc này dẫn tới thiệt hại cho Nhà nước hơn 532 tỷ đồng.
Trước đó, trong phiên tòa phúc thẩm của TAND Cấp cao tại TPHCM, HĐXX đã tuyên phạt ông Tất Thành Cang 8 năm 6 tháng tù về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản gây thất thoát, lãng phí”, do liên quan vụ Công ty TNHH MTV Phát triển Công nghiệp Tân Thuận (IPC), Công ty CP phát triển Nam Sài Gòn (SADECO) phát hành giá rẻ 9 triệu cổ phần cho Công ty CP Đầu tư và Phát triển Nguyễn Kim.