Theo cáo trạng, với mục đích chiếm đoạt quyền thu phí tuyến cao tốc TPHCM - Trung Lương, ngay từ đầu ông Đinh Ngọc Hệ đã có thủ đoạn gian dối. Ông Đinh Ngọc Hệ đã chỉ đạo nhân viên làm báo cáo tài chính từ lỗ thành lãi, làm giả xác nhận của đơn vị kiểm toán trong báo cáo tài chính năm 2011, 2012 để tạo sự tin tưởng và được công nhận đủ điều kiện tham gia đấu giá.
Trúng đấu giá, Đinh Ngọc Hệ đã kéo dài thời gian thanh toán tiền mua quyền thu phí, đồng thời chỉ đạo cấp dưới dùng hợp đồng mua quyền thu phí cao tốc TPHCM - Trung Lương thế chấp tại ngân hàng vay 1.703 tỷ đồng. Quá trình thu phí, cơ quan điều tra xác định, Đinh Ngọc Hệ tiếp tục có hành vi gian dối, chỉ đạo mua và sử dụng phần mềm của Công ty Xuân Phi, che giấu doanh thu, báo cáo không đúng doanh thu thực; từ đó, đã chiếm đoạt số tiền 725 tỷ đồng.
Liên quan tới hành vi của Đinh Ngọc Hệ, ông Đinh La Thăng (cựu Bộ trưởng Bộ GTVT), ông Nguyễn Hồng Trường (cựu Thứ trưởng Bộ GTVT) đã bị truy tố về hành vi “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí”.
Bên cạnh đó, Viện Kiểm sát Nhân dân tối cao xác định nhiều người liên quan có sai phạm nhưng chưa tới mức phải xử lý hình sự, trong đó có ông Nguyễn Văn Thể (Bộ trưởng Bộ GTVT).
