Quá trình điều tra làm rõ, khi thực hiện gói thầu mua sắm trang thiết bị y tế năm 2019 do Sở Y tế tỉnh Sơn La làm chủ đầu tư, Bùi Thị Hoa (cựu Trưởng phòng Phòng Kế hoạch - Tài chính, Sở Y tế tỉnh Sơn La) đã chỉ đạo Mai Anh Tuấn (chuyên viên Phòng kế hoạch — tài chính) thông đồng với Hoàng Vũ Quyền (kinh doanh tự do) và Tạ Ngọc Chức (Tổng Giám đốc Công ty cổ phần thẩm định và đầu tư toàn cầu) để lập chứng thư thẩm định giả khống nhằm mục đích sử dụng làm giá đấu thầu, thỏa thuận để Bùi Thị Thu móc nối với Hoàng Vũ Quyền, Trần Minh Đức (nhân viên Tạp chí mỹ phẩm Hội tinh dầu Việt Nam) xây dựng hồ sơ đấu thầu; không tổ chức đánh giá hồ sơ dự thầu, không thẩm định kết quả lựa chọn nhà thầu theo quy định.
Thỏa thuận với Bùi Thị Thu điều chỉnh giảm danh mục từ 163 xuống còn 151 danh mục hàng hóa khi đã được phê duyệt và ký hợp đồng; không tiến hành nghiệm thu thiết bị hàng hóa theo đúng quy định.
Mặc dù biết Công ty Hưng Phát do Bùi Thị Thu làm Tổng Giám đốc không đủ điều kiện, năng lực nhưng Bùi Thị Hoa vẫn hợp thức để Công ty Hưng Phát trúng thầu gây thiệt hại tài sản của Nhà nước số tiền hơn 4,8 tỷ đồng. Cơ quan công tố xác định, bị can Bùi Thị Hoa với vai trò chủ mưu trong vụ án, bị can Mai Anh Tuấn đồng phạm với vai trò người thực hành.
Cáo trạng cũng cho rằng, bị can Bùi Thị Thu, mặc dù biết Công ty Hưng Phát không đủ năng lực nhưng vì mục đích thông đồng với bị can Bùi Thị Hoa, Trần Minh Đức lập 2 bộ hồ sơ dự thầu “quân xanh" tham gia đấu thầu nhằm để cho Công ty Hưng Phát trúng thầu; nâng giá thiết bị y tế cao hơn thực tế; thỏa thuận, thay đổi danh mục thiết bị y tế trong hồ sơ dự thầu và hợp đồng kinh tế từ 163 danh mục xuống còn 151 danh mục; ký hợp đồng mua bán trang thiết bị y tế qua công ty trung gian do mình thành lập nhằm hợp thức việc nâng giá trang thiết bị, vật tư y tế bán cho Sở Y tế Sơn La.
Cơ quan tố tụng cho rằng, trong vụ án, bị can Sa Văn Khuyên (Phó Giám đốc Sở Y tế tỉnh Sơn La), với cương vị giúp việc cho Giám đốc Sở để chỉ đạo các hoạt động của ngành y tế, khi được phân công nhiệm vụ là Tổ trưởng tổ thẩm định kế hoạch lựa chọn nhà thầu; Tổ trưởng tổ chuyên gia đấu thầu và Tổ trưởng trong Hội đồng nghiệm thu, bị can đã không thực hiện đúng, đầy đủ nhiệm vụ được giao, thiếu trách nhiệm trong việc kiểm tra, giám sát để cán bộ cấp dưới cấu kết với các đối tượng thực hiện hành vi thông thầu, không đi nghiệm thu, bàn giao thực tế nhưng ký vào biên bản nghiệm thu, bàn giao trang thiết bị y tế được cấp phát cho các Trung tâm y tế huyện, Trạm y tế các xã trên địa bàn tỉnh Sơn La đưa vào sử dụng 10 mục hàng hóa thiết bị y tế không đúng với danh mục trong hồ sơ mời thầu, hồ sơ dự thầu và hợp đồng đã ký.
Bị cáo cũng ký hợp đồng, thanh lý hợp đồng thẩm định giá gói thầu; quyết định phê duyệt kết quả lựa chọn nhà thầu, gây thiệt hại tài sản của Nhà nước số tiền hơn 4,8 tỷ đồng. Hành vi của Sa Văn Khuyên đã phạm vào tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”.
Trong vụ án, Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Sơn La truy tố 4 cán bộ Sở Y tế tỉnh này về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”, gồm: Nguyễn Thị Kim An (cựu Giám đốc Sở), Sa Văn Khuyên (cựu Phó Giám đốc Sở). Các bị can Bùi Thị Hoa (cựu Trưởng phòng Kế hoạch - Tài chính) và Mai Anh Tuấn (cựu Chuyên viên Kế hoạch – Tài chính) bị truy tố tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”.
Các bị can Bùi Thị Thu (Tổng Giám đốc Công ty Hưng Phát), Tạ Ngọc Chức (Giám đốc Công ty Đầu tư Toàn cầu), Trần Minh Đức và Hoàng Vũ Quyển bị truy tố về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”.