Trong vụ án này, Viện kiểm sát nhân dân tối cao (Vụ 3) đã ban hành cáo trạng truy tố 14 bị can về các tội: “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”, “Đưa hối lộ”, “Nhận hối lộ” quy định tại khoản 3 Điều 222, khoản 3 Điều 356, khoản 4 Điều 364, khoản 4 Điều 354 - Bộ luật Hình sự năm 2015, sửa đổi bổ sung năm 2017.
Vụ 3 cũng truy tố các bị can đang bỏ trốn gồm: Nguyễn Thị Thanh Nhàn, Trần Mạnh Hà (Phó Tổng Giám đốc Công ty AIC), Trần Đăng Tấn (Trưởng Văn phòng đại diện Công ty AIC tại TPHCM, Đỗ Vân Trường (Tổng Giám đốc Công ty Mopha).
Liên quan tới vụ án trên, 4 bị can đang bỏ trốn đã bị truy tố ở những vụ án khác nhau. Bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn đã từng bị tuyên án trong các vụ án xảy ra tại tỉnh Quảng Ninh và bị Tòa án nhân dân TP Hà Nội tuyên 10 năm tù về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”. Tổng hợp hình phạt ở các bản án là 30 năm tù.
Bị can Trần Mạnh Hà từng bị Tòa án nhân dân cấp cao tại Hà Nội tuyên 13 năm tù về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, 12 năm tù về tội “Đưa hối lộ”; tổng hợp hình phạt là 25 năm tù.
Trở lại nội dung vụ án trên, trong 14 bị can bị truy tố có bà Trần Thị Bình Minh (cựu Phó Giám đốc Sở KH-ĐT TPHCM); ông Phan Tất Thắng (cựu Phó phòng Kinh tế thuộc sở này) cũng bị truy tố.
Theo cáo trạng, dự án đầu tư xây dựng Trung tâm công nghệ sinh học được UBND TPHCM chấp thuận chủ trương đầu tư năm 2006. Chủ đầu tư là Trung tâm công nghệ sinh học, cơ quan chủ quản là Sở NNPT-NT TPHCM.
Trong một sự kiện, cựu Chủ tịch Công ty AIC đã giới thiệu các cấp dưới làm quen với bà Trần Thị Bình Minh (khi đó đang là Phó Giám đốc Sở KH-ĐT TPHCM) để nhờ giúp đỡ nhằm "thâu tóm" các gói thầu tại Trung tâm công nghệ sinh học TPHCM.
Kết quả điều tra xác định bà Trần Thị Bình Minh đã bỏ qua sai sót, tạo điều kiện cho Công ty AIC trúng thầu dự án 12 phòng thí nghiệm, gây thiệt hại 33 tỷ đồng.
Theo cáo trạng, do được tạo điều kiện khi thẩm định điều chỉnh dự án, dự toán, Phó Tổng Giám đốc AIC đã bốn lần đến gửi quà bà Minh tổng 900 triệu đồng.
Sau khi trúng các gói thầu từ năm 2015 đến năm 2018, bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn đã chỉ đạo Trần Mạnh Hà và ông Trần Đăng Tấn đưa tiền 6 lần cho ông Dương Hoa Xô (cựu Giám đốc Trung tâm công nghệ sinh học TPHCM) với tổng số tiền là 14,4 tỷ đồng. Viện Kiểm sát nhân dân tối cao cáo buộc bà Trần Thị Bình Minh được hưởng lợi bất chính 1,9 tỷ đồng và đã tiêu dùng cá nhân.
