Chính phủ chỉ đạo UBND TPHCM có trách nhiệm đánh giá kết quả thực hiện thí điểm Ban Quản lý an toàn thực phẩm; phối hợp các bộ, ngành trong quá trình nghiên cứu, sửa đổi các quy định pháp luật có liên quan.
Trước đó, UBND TPHCM đã có tờ trình kiến nghị Thủ tướng cho phép kéo dài thời gian thí điểm hoạt động của Ban Quản lý an toàn thực phẩm. Theo UBND TPHCM, Ban Quản lý an toàn thực phẩm là mô hình mới, được Thủ tướng cho phép TPHCM thí điểm từ tháng 12-2016, kéo dài 3 năm.
Đến ngày 1-4-2020, Thủ tướng cho phép kéo dài thời gian thí điểm thêm 3 năm. Qua 6 năm, UBND TPHCM đánh giá Ban Quản lý an toàn thực phẩm đã bước đầu khẳng định chủ trương đúng đắn về thành lập mô hình cơ quan đầu mối quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm.