Tuy nhiên, thời gian gần đây, hệ thống quan trắc chất lượng nguồn nước của Bộ TN-MT ghi nhận chất lượng nguồn nước các con sông này, nhất là sông Sài Gòn đang có dấu hiệu ô nhiễm nghiêm trọng.
Nhằm khắc phục tình trạng trên, Sở TN-MT TPHCM cho biết, TPHCM sẽ tăng cường xử phạt tổ chức, doanh nghiệp, cá nhân có hành vi vi phạm môi trường; đồng thời duy trì quy chế phối hợp về quản lý nhà nước trong lĩnh vực tài nguyên nước, tài nguyên khoáng sản và bảo vệ môi trường ở các vùng giáp ranh địa giới hành chính giữa TPHCM và các tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu, Đồng Nai, Bình Dương, Tây Ninh, Long An, Tiền Giang, Bình Phước và Lâm Đồng. Ngoài ra, TPHCM cũng đã ký kế hoạch liên tỉnh với tỉnh Bình Dương nhằm tăng cường phối hợp kiểm soát và giải quyết ô nhiễm tuyến kênh Ba Bò và tuyến suối Nhum - suối Xuân Trường - suối Cái và các con sông nói trên.
