Quy chế phối hợp hướng đến việc trao đổi thông tin, phối hợp tuần tra, kiểm tra, kiểm soát nhằm phát hiện, ngăn chặn và xử lý nghiêm các hành vi vi phạm pháp luật trong lĩnh vực bảo vệ nguồn lợi thủy sản và quản lý hoạt động khai thác hải sản đối với tổ chức, cá nhân Việt Nam và nước ngoài trên vùng biển thuộc tỉnh Sóc Trăng và vùng biển ngoài khơi Việt Nam.
Bên cạnh đó, UBND tỉnh Sóc Trăng và Bộ Tư lệnh Vùng Cảnh sát biển 4 còn phối hợp thực hiện công tác đăng ký, đăng kiểm tàu cá, cấp phép khai thác thủy sản; quản lý cảng cá, khu neo đậu tránh trú bão cho tàu cá; kết hợp chặt chẽ thực hiện nhiệm vụ bảo vệ chủ quyền với bảo vệ ngư dân khai thác hải sản hợp pháp trên các vùng biển; sẵn sàng hỗ trợ, giúp đỡ ngư dân khắc phục sự cố trên biển; tư vấn sức khoẻ, khám chữa bệnh…