Chủ tọa phiên tòa là thẩm phán Phạm Lương Toản, Chánh tòa Hình sự TAND TPHCM.
Các bị cáo: Nguyễn Thị Thanh Nhàn (Chủ tịch HĐQT kiêm Tổng Giám đốc Công ty AIC), Trần Mạnh Hà, Trần Đăng Tấn (là cấp dưới của Nhàn tại AIC) hầu tòa về tội "Đưa hối lộ" và "Vi phạm quy định gây hậu quả nghiêm trọng".
Bị cáo Dương Hoa Xô (cựu Giám đốc Trung tâm CNSH TPHCM) bị xét xử về tội "Nhận hối lộ".
Các bị cáo Trần Thị Bình Minh (cựu Phó Giám đốc Sở KH-ĐT TPHCM), Phan Tất Thắng (cựu Phó Trưởng phòng kinh tế ngành, Sở KH-ĐT TPHCM) hầu tòa về tội "Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
Ngoài ra, 8 bị cáo khác bị xét xử về tội "Vi phạm quy định đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng".
Theo cáo trạng, dự án đầu tư mua sắm trang thiết bị 12 phòng thí nghiệm thuộc trung tâm Công nghệ sinh học được UBND TPHCM chấp thuận từ năm 2006. Khoảng tháng 4-2014, Nguyễn Thị Thanh Nhàn đặt vấn đề và được Dương Hoa Xô đồng ý tạo điều kiện để Công ty AIC tham gia thực hiện dự án mua sắm thiết bị 12 phòng thí nghiệm.
Bị cáo Trần Mạnh Hà (Tổng Giám đốc Công ty AIC) đã giúp Nhàn gặp gỡ, tiếp xúc và đặt vấn đề với ông Xô về việc chỉ đạo cho Công ty AIC trúng thầu trái luật. Trần Đăng Tấn (Trưởng văn phòng đại diện Công ty AIC tại TPHCM) đã liên hệ chủ đầu tư để thông đầu về danh mục, giá thiết bị trước khi đầu thầu; thiết lập “quân xanh”, “quân đỏ” để Công ty AIC và các công ty do Công ty AIC chỉ định trúng 8 gói thầu.
Hành vi của các bị cáo gây thiệt hại cho nhà nước hơn 94,6 tỷ đồng. Sau khi được ông Xô tạo điều kiện để trúng thầu, bà Nhàn đã chỉ đạo Trần Mạnh Hà, Trần Đăng Tấn đưa ông Xô tổng cộng 14,4 tỷ đồng để cám ơn.
Sau khi nhận 14,4 tỷ đồng, ông Xô đã đưa cho cho bà Trần Thị Bình Minh (Phó Giám đốc Sở KH-ĐT) 1 tỷ đồng; đưa cho Nguyễn Đăng Quân (Phó Giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học) 950 triệu đồng; Nguyễn Viết Thạch (Trưởng ban Quản lý xây dựng công trình thuộc Trung tâm Công nghệ sinh học) 1,1 tỷ đồng. Số tiền còn lại là 11,3 tỷ đồng, ông Xô sử dụng vào mục đích cá nhân và hiện đã nộp lại toàn bộ.
Bà Trần Thị Bình Minh chỉ đạo Phan Tất Thắng lập tờ trình để ký quyết định phê duyệt điều chỉnh dự án khi chưa tổ chức thẩm định; không thực hiện thủ tục cần thiết để xử lý sai phạm của chủ đầu tư. Từ đó, tạo điều kiện cho Trung tâm Công nghệ sinh học TPHCM và Công ty AIC nâng giá dự toán giai đoạn 1, nâng giá gói thầu giai đoạn 2 và 3 gây thiệt hại cho nhà nước hơn 33 tỷ đồng. Bà Minh hưởng lợi bất chính 1,9 tỷ đồng, Thắng hưởng lợi 50 triệu đồng.
Cũng theo cáo trạng, trong vụ án này các bị cáo: Nguyễn Thị Thanh Nhàn, Trần Mạnh Hà, Trần Đăng Tấn đang bỏ trốn, gây khó khăn cho việc giải quyết vụ án. Cơ quan CSĐT Bộ Công an đã quyết định truy nã nhưng không có kết quả; phát thư kêu gọi ra đầu thú để hưởng chính sách khoan hồng của Đảng và Nhà nước; đồng thời, áp dụng đầy đủ các biện pháp để đảm bảo thực hiện quyền bào chữa theo quy định; trường hợp không ra đầu thú coi như từ bỏ quyền bào chữa và bị truy tố, xét xử.
Liên quan đến Nguyễn Thị Thanh Nhàn, năm 2023, TAND TP Hà Nội xử sơ thẩm và TAND Cấp cao tại Hà Nội xử phúc thẩm, tuyên phạt Nguyễn Thị Thanh Nhàn 30 năm tù về các tội vi phạm đấu thầu, đưa hối lộ liên quan Bệnh viện đa khoa Đồng Nai.
Tháng 10-2023, TAND TP Quảng Ninh xét xử sơ thẩm trong vụ án thông thầu Bệnh viện Sản nhi Quảng Ninh. Đầu năm 2024, TAND Cấp cao tại Hà Nội xét xử phúc thẩm vụ án, tuyên phạt bà Nhàn 10 năm tù về tội vi phạm quy định đấu thầu. Tổng hợp hình phạt các bản án là 30 năm tù.
Vụ án tại Trung tâm Công nghệ sinh học TPHCM là vụ án thứ 3 bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn bị truy tố và chuẩn bị đưa ra xét xử.
Tháng 12-2023, bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn tiếp tục bị khởi tố về hành vi vi phạm quy định đấu thầu trong vụ án xảy ra tại Trung tâm ứng cứu khẩn cấp máy tính Việt Nam (VNCERT) thuộc Bộ TT-TT.