Theo đó, UBND tỉnh Quảng Ngãi quyết định giao Sở NN-PTNT tỉnh Quảng Ngãi làm chủ đầu tư, mục tiêu đầu tư nâng cấp, sửa chữa hoàn thiện hạ tầng các cảng cá, cảng neo trú tàu thuyền Lý Sơn, Sa Huỳnh, Sa Kỳ, Tịnh Hòa và Mỹ Á với tổng mức đầu tư 32 tỷ đồng từ nguồn ngân sách tỉnh.
Mục tiêu nhằm đáp ứng tiêu chuẩn phân loại cảng cá theo quy định của Luật Thủy sản, đảm bảo khả năng tiếp nhận tàu cá hoạt động từ vùng khơi trở ra cập cảng chỉ định, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ chống khai thác hải sản bất hợp pháp, không báo cáo và không theo quy định (IUU). Đồng thời, tăng cường kiểm soát hoạt động nghề cá trên địa bàn tỉnh, xây dựng nghề cá có trách nhiệm và phát triển bền vững.
Quy mô đầu tư trạm xử lý nước thải cảng Sa Huỳnh với công suất thiết kế 75m3/ngày đêm, cảng Sa Kỳ là 100m3/ngày đêm, cảng Tịnh Hòa là 55m3/ngày đêm, cảng Lý Sơn là 10m3/ngày đêm.
Xây dựng hệ thống thu gom nước thải, hệ thống phòng cháy chữa cháy tại các cảng với công suất phù hợp theo quy định. Đồng thời, mở rộng cầu cảng dài 40m, rộng 10m tại cảng Mỹ Á.