Trong số này có nhiều hang động có ý nghĩa về khoa học được ví như bảo tàng chứa đựng các thông tin về quá trình hình thành lớp vỏ trái đất từ hơn 400 triệu năm và có thể lâu hơn.
Tiêu biểu là hệ thống động Phong Nha có 157 động với tổng chiều dài trên 103km, hệ thống hang Vòm có 58 động được khảo sát và chiều dài trên 48km, hệ thống hang Nước Moọc có 60 động và trên 20km được khảo sát. Nổi bật nhất trong các hệ thống này có động Phong Nha, Tiên Sơn, Sơn Đoòng, Thiên Đường, Va, Én...
Theo ông Phạm Hồng Thái, các nhà khoa học ước tính có hơn 1.000 hang động trong khu vực VQG Phong Nha-Kẻ Bàng và vùng phụ cận.
"Trong 30 năm khảo sát, mới chỉ đo vẽ được 404 hang động; vẫn còn hơn 600 hang động đang trong rừng già chờ khám phá. Trong tương lai sẽ ứng dụng cộng nghệ AI vào khám phá hang động và sẽ số hóa toàn bộ để phục vụ nghiên cứu khoa học, phát triển du lịch số", ông Thái cho biết.