Bên cạnh những thành quả tích cực đã đạt được, thành phố vẫn còn nhiều vấn đề tồn tại, hạn chế trong việc bảo vệ nguồn nước, giữ gìn vệ sinh môi trường, nguyên nhân do quá trình đô thị hóa nhanh.
Để khắc phục, UBND TPHCM đã yêu cầu sở ngành, quận huyện phối hợp thực hiện các giải pháp bảo vệ môi trường.
Cụ thể, Sở NN-PTNT triển khai thực hiện các mô hình xử lý chất thải từ hoạt động sản xuất nông nghiệp như hướng dẫn sử dụng an toàn, thu gom bao bì, vỏ chai thuốc bảo vệ thực vật theo đúng quy định; kiểm tra hoạt động giết mổ gia súc.
Để không còn tình trạng xả rác sai quy định, Sở Tài nguyên và Môi trường tăng cường tuyên truyền nâng cao nhận thức cộng đồng về bảo vệ môi trường; rà soát các điểm hẹn rác, trạm trung chuyển rác và khẩn trương thực hiện kế hoạch chuyển đổi xe thu gom rác; tăng cường mạng lưới các thùng rác công cộng; tăng cường kiểm tra, giám sát công tác thu gom, vận chuyển chất thải.
Sở Y tế tuyên truyền người dân sử dụng nước sạch trong sinh hoạt, nâng cao ý thức tiết kiệm và bảo vệ nguồn nước; kiểm tra chất lượng nước sinh hoạt của các hộ dân.
Song song đó, vận động người dân sử dụng tiết kiệm nguồn nước sạch, chung tay bảo vệ môi trường bằng những việc làm thiết thực như không xả rác, không sử dụng túi ni lông khó phân hủy; dành 15 phút mỗi ngày làm sạch khu vực trước cửa nhà. UBND các quận huyện triển khai rà soát, tổ chức, sắp xếp đội ngũ thu gom rác dân lập, thông tin thời gian thu gom; giải quyết điểm đen về rác, không để rác lưu trữ lâu ngày; tổng vệ sinh các tuyến đường, khơi thông kênh rạch; tăng cường công tác kiểm tra, xử lý các cơ sở sản xuất, kinh doanh có khả năng gây ô nhiễm môi trường…