Huyền trước đây là thủ quỹ của Trường Chính trị tỉnh Đắk Lắk.
Theo cáo trạng, tháng 3-2018, Trường Chính trị tỉnh Đắk Lắk đã trình báo với Công an TP Buôn Ma Thuột về việc trộm đột nhập phòng thủ quỹ, mở két sắt và lấy trộm trên 500 triệu đồng. Ngày 23-7-2018, vụ án đã được chuyển giao cho Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Đắk Lắk tiếp tục điều tra xử lý. Tuy nhiên, đến ngày 29-3-2019, việc điều tra đã tạm dừng do hết thời hạn mà không xác định được đối tượng gây án.
Qua rà soát các tài liệu do Nguyễn Thị Huyền cung cấp, các cơ quan chức năng xác định tổng số tiền các cá nhân tạm ứng tại Trường Chính trị từ tháng 4-2017 đến tháng 3-2018 hơn 285 triệu đồng. Trong đó, ứng tiền có lãnh đạo, kế toán duyệt là 195.183.000 đồng; thủ quỹ tự cho tạm ứng, không báo cáo lãnh đạo, kế toán là 90,3 triệu đồng. Toàn bộ số tiền cho tạm ứng không cập nhật trên sổ quỹ tiền mặt của thủ quỹ và kế toán.
Sau khi vụ việc đột nhập xảy ra, các cá nhân đã hoàn ứng hơn 210 triệu đồng trong năm 2018 và đầu năm 2019 nhưng Huyền chỉ nhập quỹ số tiền 124 triệu đồng. Phần còn lại 86 triệu đồng, Huyền tự ý giữ lại, không nhập quỹ, không ghi sổ và sử dụng cho mục đích cá nhân.
Ngày 7-9-2021, khi bàn giao công tác cho thủ quỹ mới, Nguyễn Thị Huyền đã không đề cập đến số tiền này.
Quá trình điều tra, cũng như tại phiên tòa Nguyễn Thị Huyền đã thành khẩn khai báo, bị can đã khắc phục toàn bộ hậu quả thiệt hại cho Trường Chính trị bằng cách giao nộp toàn bộ số tiền chiếm đoạt 86 triệu đồng cho Cơ quan điều tra.
Qua các tài liệu thu thập cũng như quá trình xét xử, HĐXX TAND tỉnh Đắk Lắk tuyên phạt Nguyễn Thị Huyền 3 năm 6 tháng tù về tội Tham ô tài sản.