Trong đó, công dân khi thực hiện các thủ tục đăng ký cư trú qua cổng dịch vụ công trực tuyến sẽ được giảm 50% lệ phí.
Thông tư này cũng quy định nhiều trường hợp miễn lệ phí, các nhóm này gồm: trẻ em theo quy định tại Luật Trẻ em, người cao tuổi theo quy định tại Luật Người cao tuổi, người khuyết tật theo quy định tại Luật Người khuyết tật.
Người có công với cách mạng và thân nhân của người có công với cách mạng theo quy định tại Pháp lệnh Ưu đãi người có công với cách mạng. Đồng bào dân tộc thiểu số ở các xã có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn, công dân thường trú tại các xã biên giới, công dân thường trú tại các huyện đảo, công dân thuộc hộ nghèo theo quy định của pháp luật, công dân từ đủ 16 tuổi đến dưới 18 tuổi mồ côi cả cha và mẹ.
Thông tư cũng quy định, người đăng ký thường trú trực tuyến chỉ phải nộp 10.000 đồng/lần (so với nộp hồ sơ trực tiếp là 20.000 đồng/lần), đăng ký tạm trú trực tuyến có mức phí 7.000 đồng/lần (nộp hồ sơ trực tiếp là 15.000 đồng/lần), lệ phí tách hộ khi làm hồ sơ online là 5.000 đồng/lần.