Cụ thể như tăng cường kiểm tra, chấn chỉnh việc quản lý khoán thuế của cơ quan thuế ở cơ sở. Mục tiêu của ngành thuế là “quản lý chặt chẽ, thu thuế đúng, đủ, kịp thời đối với hộ kinh doanh lớn; chống thất thu đối với hộ khoán…”. Do vậy, Tổng cục Thuế tập trung chấn chỉnh công tác quản lý khoán thuế đối với cơ sở kinh doanh theo hướng chuyển mạnh hộ kinh doanh quy mô lớn, hộ kinh doanh ngành nghề, lĩnh vực có nhiều rủi ro đang quản lý theo mô hình khoán sang nộp thuế theo kê khai và hạch toán kế toán, tránh việc thỏa thuận ngầm giữa cán bộ thuế và hộ kinh doanh, tránh lợi dụng núp bóng hộ khoán để sử dụng hóa đơn của cơ quan thuế vào các mục đích bất hợp pháp.
Riêng việc chống thất thu đối với doanh nghiệp ngoài quốc doanh và hộ kinh doanh trong lĩnh vực ăn uống, thương mại, dịch vụ, ngành thuế sẽ phân theo ngành, nhóm ngành để đối chiếu và quản lý đầu ra - đầu vào của hàng hóa. Tổng cục Thuế căn cứ cơ sở dữ liệu toàn ngành, đồng thời đối chiếu với thực tế quản lý và cơ sở dữ liệu tại địa bàn để lập danh sách đối tượng có dấu hiệu rủi ro để tiến hành kiểm tra. Đối với việc kiểm tra doanh nghiệp và hộ kinh doanh, cơ quan thuế tùy theo từng lĩnh vực ngành nghề kinh doanh sẽ phối hợp với các cơ quan liên quan như công an, quản lý thị trường, văn hóa - thể thao và du lịch… cùng thành lập đoàn kiểm tra liên ngành thực hiện kiểm tra, khảo sát tại địa điểm kinh doanh. Trường hợp sau khi kiểm tra có dấu hiệu hoạt động kinh doanh phức tạp, quy mô lớn; kinh doanh liên kết nhằm mục đích trốn thuế thì báo cáo lãnh đạo cơ quan thuế thực hiện thanh tra chống thất thu thuế theo quy định.
