Tai nạn xảy ra lúc khoảng 4 giờ cùng ngày, một chiếc ô tô tải hạng nặng chở gỗ bất ngờ lao lên đường sắt, đúng lúc tàu SE4 chạy hướng Nam ra Bắc đi đến. Vụ va chạm mạnh khiến đầu máy tàu hỏa văng khỏi đường tàu 8m, 2 toa hành lý, bưu vụ phát điện bị trật bánh, xoay ngang.
Vụ tai nạn khiến lịch trình nhiều đoàn tàu tết bị ảnh hưởng. Ngành đường sắt phải chuyển tải toàn bộ hành khách trên tàu SE4 về ga Hà Nội; cho tàu SE2 xuất phát Sài Gòn ngày 25-1 kết thúc hành trình tại ga Phủ Lý và lập tàu SE5 tại ga Phủ Lý ngày 27-1, hơn 200 hành khách đã được chuyển tải bằng ô tô từ ga Phủ Lý đến ga Hà Nội và ngược lại.
Riêng tàu SE7 chạy ngày 27-1 bãi bỏ đoạn từ Hà Nội đi Vinh, chỉ xuất phát từ ga Vinh. Hành khách có vé đi tàu SE7 các ga từ Hà Nội đi Vinh được trả vé không thu phí.
Đến trưa 27-1, đường sắt Bắc - Nam thông tuyến trở lại. Nguyên nhân tai nạn được xác định do tài xế xe tải bị mất lái.
