Mặc dù bão số 5 đã đổ bộ và không mạnh như dự kiến nhưng để đảm bảo tuyệt đối an toàn bay, tránh tác động tiêu cực của thời tiết xấu do ảnh hưởng của bão, các hãng hàng không vẫn phải thông báo chậm/ huỷ nhiều chuyến bay trong ngày 18-9 và lên kế hoạch bay bù trong ngày 19-9.
Trong ngày 18-9, nhiều chuyến bay đến, đi từ sân bay Vinh (Nghệ An) đã bị chậm chuyến từ 2-6 giờ 30 phút so với lịch khởi hành. Cụ thể, các chuyến bay bị ảnh hưởng bao gồm: 4 chuyến bay VN7719, VN7718, VN7715, VN7714 giữa Hà Nội – Vinh; 8 chuyến bay VN1262, VN1263, VN7264, VN7265, VN1260, VN1261, VN1264, VN1265 giữa TPHCM – Vinh; 2 chuyến bay VN1691, VN1690 giữa Vinh – Buôn Ma Thuột.
Đồng thời, Vietnam Airlines đã tiến hành hủy 30 chuyến bay trong ngày 18-9 và triển khai 22 chuyến bay bù vào ngày 19-9.
Tương tự, Hãng hàng không thành viên Pacific Airlines lùi thời gian khai thác 2 chuyến bay BL6054 và BL6055 trên đường bay giữa TPHCM và Đà Nẵng sang sau 20h00 cùng ngày.
Cũng trong ngày 18-9, hãng Bamboo Airway cũng phải huỷ 8 chuyến bay; hãng hàng không Vietjet huỷ 20 chuyến bay đến và đi từ các sân bay khu vực miền Trung.
Hành khách trên các chuyến bay bị ảnh hưởng được các hãng hỗ trợ theo quy định, nếu có yêu cầu sẽ được chuyển đổi miễn phí sang các chuyến bay khác trong trường hợp còn chỗ.