Trước đó, qua công tác nắm tình hình, cơ quan chức năng phát hiện trên địa bàn huyện Quỳ Hợp có tình trạng lập khống báo cáo đánh giá hiện trạng môi trường để thanh toán tiền ngân sách, gây thiệt hại cho Nhà nước. Trước tình hình đó, lãnh đạo Công an tỉnh Nghệ An đã chỉ đạo Phòng Cảnh sát điều tra tội phạm về tham nhũng, kinh tế, buôn lậu, môi trường điều tra làm rõ.
Căn cứ kết quả điều tra, ngày 25-4, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Nghệ An đã khởi tố vụ án "Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ" xảy ra tại Ban Quản lý các cụm công nghiệp trên địa bàn huyện Quỳ Hợp; đồng thời khởi tố bị can đối với Nguyễn Thị Hồng Nhung (sinh năm 1984, chuyên viên Phòng Tài chính - Kế hoạch UBND huyện Quỳ Hợp), Phạm Thị Giang (sinh năm 1995, nhân viên Công ty Cổ phần môi trường Việt Anh) về cùng tội danh.
Mở rộng điều tra vụ án, ngày 10-6, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Nghệ An đã khởi tố, bắt tạm giam Trần Đức Lợi và Nguyễn Văn Khoa.
Hiện vụ án đang được mở rộng điều tra.