Ngân hàng là dự án do Trung tâm Nông nghiệp nhiệt đới quốc tế (CIAT) thực hiện, với số vốn đầu tư ban đầu 17,2 triệu USD từ nhiều nguồn đóng góp, nhằm bảo tồn đa dạng sinh học thực vật, hỗ trợ nghiên cứu nông nghiệp trên thế giới. Dự án còn nhận thêm 17 triệu USD từ nhà sáng lập Amazon Jeff Bezos, thông qua Quỹ Trái đất Bezos.
Theo CIAT, các bộ sưu tập hạt giống đậu, sắn và thức ăn gia súc chuyển đến ngân hàng được thu thập trong 40 năm qua tại hơn 140 quốc gia, đã tạo thành một kho tàng lớn về các loài và giống bản địa. Ngân hàng đóng vai trò như một thư viện di truyền, để phát triển thêm các giống cây trồng mới thích nghi với các điều kiện trồng trọt cụ thể trên thế giới. Bên cạnh đó, ngân hàng sẽ cho phép phân phối mẫu miễn phí cho nông dân và các nhà nghiên cứu trên khắp thế giới, cũng như tăng cường năng lực của các hộ nông dân nhỏ trong việc thích ứng với biến đổi và đa dạng khí hậu.
Chính phủ Colombia hy vọng rằng ngân hàng hạt giống sẽ giúp cung cấp các giống cây trồng có khả năng chống chịu với biến đổi khí hậu và đảm bảo an ninh lương thực, đưa quốc gia Nam Mỹ này trở thành nhà cung cấp hạt giống di truyền cho nông dân trên toàn cầu.