Theo Trung tâm KTTV Quốc gia, những ngày cuối tháng 5, do ảnh hưởng của lũ tuyến trên kết hợp với triều cường, mực nước tại trạm Tân Châu và Châu Đốc cao hơn rất nhiều so với trung bình nhiều năm (TBNN) cùng kỳ và ở mức cao hơn cùng kỳ năm 2000 khoảng 0,1 - 0,3m.
Lượng mưa trung bình trong năm 2017 cao hơn mức TBNN; mực nước đo được ở khu vực đầu nguồn sông Cửu Long trong những tháng mùa khô cao hơn TBNN từ 0,45 - 0,55m. Do mùa mưa năm 2017 đến sớm và lượng mưa cao hơn so với TBNN, do đó khả năng lũ đầu nguồn sông Cửu Long sẽ đến sớm.
Dự báo đến cuối tháng 7-2017 mực nước tại trạm Tân Châu và Châu Đốc khả năng ở mức 2,5 - 3m. Đỉnh lũ năm 2017 khả năng sẽ xảy ra vào nửa đầu tháng 10-2017, ở mức báo động 2 - báo động 3 (sông Tiền tại Tân Châu từ 4,0 - 4,5m, sông Hậu tại trạm Châu Đốc từ 3,5 - 4,0m).
Theo dự báo, đỉnh lũ năm 2017 xấp xỉ năm 2016 và tương đương đỉnh lũ TBNN nhưng tiềm ẩn nguy cơ xảy ra lũ lên nhanh hơn bình thường, do mưa lớn cực đoan xuất hiện, tập trung nhiều ngày trên khu vực thượng nguồn sông Mê Công kết hợp với việc điều tiết dòng chảy từ thượng nguồn của các hồ thủy điện.
Nhằm giảm thiểu thấp nhất thiệt hại do lũ, ngập lụt có thể gây ra trong năm 2017, Trung tâm KTTV Trung ương khuyến cáo các địa phương cần theo dõi sát tình hình thời tiết, thủy văn lưu vực sông Mê Công thông qua bản tin dự báo của Trung tâm dự báo KTTV Trung ương, Đài KTTV Nam bộ và các đài KTTV địa phương để chủ động ứng phó kịp thời.