Bộ GD-ĐT cho rằng, lộ trình học phí hiện nay chưa đáp ứng được theo yêu cầu của Nghị quyết 19-NQ/TW (về tiếp tục đổi mới hệ thống tổ chức và quản lý, nâng cao chất lượng và hiệu quả hoạt động của các đơn vị sự nghiệp công lập) vì khung và mức thu học phí còn quá thấp, chưa đủ bù đắp chi phí đào tạo.