Để hạn chế tác động con người lên tài nguyên du lịch địa chất, địa mạo của đảo Lý Sơn, nhất đối với các kiến trúc vật lý “dễ bị tổn thương”, trong đó có Cổng Tò Vò, Ông Nguyễn Viết Vy, Bí thư Huyện ủy Lý Sơn, cho biết: “Huyện Lý Sơn khuyến nghị du khách không trèo leo lên Cổng Tò Vò, đặc biệt tại các điểm cao, phiến đá mỏng”.
Hiện nay, Cổng Tò Vò đang đứng trước nguy cơ xâm thực từ sóng biển, do Cổng Tò Vò nằm ở mặt nước biển, tác động sóng dẫn đến bào mòn cấu trúc đá, khiến cho cấu trúc càng mỏng hơn.
Cổng Tò Vò có đặc điểm dạng địa hình chạm trổ, quá trình phong hóa, bóc mòn và tác động của sóng biển vào cấu trúc núi lửa đã hình thành các thềm biển cao 3-4m tạo nên các vách biển và dạng địa hình cầu thiên nhiên Cổng Tò Vò.
Các nhà khoa học, nghiên cứu đã nhận thấy tài nguyên du lịch địa chất, địa mạo với cốt lõi là các di sản có giá trị quốc gia và quốc tế trên đảo Lý Sơn tuy hấp dẫn, độc đáo xong lại rất dễ bị tổn thương, cả về mặt vật lý vẫn tổn thương cấu trúc tự nhiên.
Về mặt vật lý, các di sản này thường được cấu tạo từ đá trầm tích gắn kết yếu hoặc từ đá nứt nẻ lại bị phong hóa nên dễ sập đổ.
Do vậy, huyện Lý Sơn khuyến nghị du khách không trèo leo lên Cổng Tò Vò. Trước đó, đã xảy ra tình trạng sạt lở tại Chùa Đục và nứt núi Giếng Tiền, hiện vẫn chưa khắc phục.