Lễ giỗ chung các liệt sĩ được khởi xướng khoảng năm 2008. Trong những năm đầu chỉ có cán bộ, công nhân viên (CB-CNV) của khu bảo tồn, nhưng sau đó có sự tham gia của lãnh đạo tỉnh, huyện, nhân dân các xã ở quanh khu di tích cùng đồng đội, thân nhân các liệt sĩ. Và ngày 21-4 năm nay cũng vậy, lễ giỗ diễn ra ấm cúng, trang trọng với sự có mặt của Chủ tịch HĐND tỉnh, Phó Chủ tịch UBND tỉnh Đồng Nai, lãnh đạo huyện Vĩnh Cửu, CB-CNV khu bảo tồn cùng nhiều đồng đội, thân nhân liệt sĩ.
Vào các ngày lễ, tết trong năm, tại Khu di tích quốc gia Trung ương Cục miền Nam đều có nhiều đoàn công tác của Trung ương, tỉnh, huyện và quân đội đến dâng hương, dâng hoa nhưng ấm cúng nhất vẫn là ngày giỗ chung của các liệt sĩ. Trong cuộc kháng chiến chống Mỹ, đây từng là nơi đóng quân của Quân y viện K72 (Bệnh viện dã chiến của Trung ương Cục miền Nam và Quân chủ lực miền) vừa cứu chữa thương binh vừa đào tạo đội ngũ quân y, kịp thời cung cấp cho các chiến trường và chỉ riêng số liệt sĩ hy sinh tại đây theo thống kê của K72 đã lên đến gần 600 người.
Về lý do lấy ngày 21-4 làm ngày giỗ chung, TS Trần Văn Mùi (nguyên Giám đốc khu bảo tồn) cho biết, trong quá trình tập hợp các phần mộ liệt sĩ cho thấy, có nhiều bia mộ ghi ngày hy sinh là 22-4-1975. Đây là thời gian diễn ra trận đánh ác liệt vào Xuân Lộc - Long Khánh được xem là cánh cửa thép bảo vệ Sài Gòn, một lượng lớn bộ đội bị thương được đưa về đây cứu chữa và nhiều người đã nằm lại nơi những cánh rừng chiến khu Đ. Theo truyền thống, giỗ lấy ngày người còn sống nên khu bảo tồn chọn ngày 21-4 để làm giỗ chung cho các liệt sĩ.
Căn cứ trên các bia mộ có sẵn và một số dấu vết có mộ liệt sĩ, khu bảo tồn đã tập hợp, xây dựng được khu mộ liệt sĩ với 70 mộ, hy sinh từ những ngày đầu lập căn cứ Trung ương Cục miền Nam (1961-1962) đến ngày 30-4-1975, để khách hành hương về nguồn có dịp thắp hương tưởng nhớ, tri ân các liệt sĩ. Vào ngày này, khách hành hương cũng được nghe thuyết minh về một thời kỳ sống, chiến đấu trong gian khổ gắn liền với tên tuổi của các đồng chí lãnh đạo cấp cao của Đảng và Nhà nước, trong đó có cố Tổng Bí thư Nguyễn Văn Linh.
Lễ giỗ chung liệt sĩ hy sinh ở căn cứ Trung ương Cục miền Nam (chiến khu Đ) chính là dịp để giáo dục truyền thống “uống nước nhớ nguồn” không chỉ cho CB-CNV khu bảo tồn mà cả giới trẻ hôm nay nhằm tri ân, tưởng nhớ công lao của các anh hùng liệt sĩ đã xả thân vì nền độc lập, tự do của Tổ quốc.