Thông báo của Văn phòng Chính phủ về kết luận của Phó Thủ tướng sau cuộc họp nêu rõ, Phó Thủ tướng đã giao Chủ tịch UBND tỉnh Phú Yên nghiêm túc tổ chức thực hiện các kiến nghị của Thanh tra Chính phủ; chấn chỉnh, khắc phục xử lý những tồn tại, sai phạm để nâng cao hiệu quả quản lý nhà nước trong lĩnh vực quản lý đầu tư xây dựng, quản lý sử dụng đất đai, nâng cao vai trò, trách nhiệm các đơn vị chức năng trong tỉnh; tổ chức kiểm điểm rút kinh nghiệm, có hình thức xử lý thích hợp đối với các tập thể, cá nhân có vi phạm theo đúng quy định.
Phó Thủ tướng cũng yêu cầu các bộ, NN-PTNT, TN-MT, Xây dựng kiểm điểm, rút kinh nghiệm về công tác chỉ đạo, hướng dẫn công tác quản lý nhà nước chuyên ngành thuộc chức năng của bộ; theo dõi, giám sát việc tổ chức thực hiện các kiến nghị của Thanh tra Chính phủ nhằm chấn chỉnh những tồn tại trong công tác quản lý, sử dụng đất đai; quản lý, bảo vệ và phát triển rừng tại tỉnh Phú Yên.
Phó Thủ tướng giao Thanh tra Chính phủ chủ trì, phối hợp với các bộ NN-PTNT, Công an, TN-MT, Xây dựng và các cơ quan chức năng, các cơ quan trong hệ thống chính trị, các tổ chức chính trị xã hội trên địa bàn thành lập Tổ công tác kiểm tra, xác minh việc chuyển mục đích sử dụng (khoảng 16ha) rừng đặc dụng Đèo Cả để thực hiện Dự án khai thác khoáng sản đất, san lấp vật liệu xây dựng thông thường phục vụ thi công dự án Hầm đường bộ Đèo Cả của Công ty cổ phần Tập đoàn Hải Thạch; kiến nghị Thủ tướng Chính phủ biện pháp giải quyết theo quy định của pháp luật. UBND tỉnh Phú Yên khẩn trương rà soát lại hiện trạng và tính toán hiệu quả kinh tế - xã hội của các dự án có liên quan đến chuyển mục đích sử dụng rừng và đất rừng trên địa bàn toàn tỉnh; trao đổi, thống nhất với các bộ ngành, các cơ quan liên quan để xem xét xử lý các tồn tại, vướng mắc theo thẩm quyền, đúng quy định của pháp luật.
Riêng Dự án khu du lịch liên hợp cao cấp New City Việt Nam, yêu cầu Thanh tra Chính phủ tiếp tục kiểm tra có kết luận rõ đúng sai về dư luận báo chí phản ảnh (phá hàng trăm hécta rừng xây sân golf, khách sạn, resort nhưng đến nay vẫn chưa có hồ sơ xin phép Thủ tướng Chính phủ cho chuyển mục đích sử dụng đất theo quy định…).