Trước đó, ngày 17-11-2020, Bộ GTVT đã có văn bản chỉ đạo Cục Hàng không Việt Nam sớm hoàn thiện hồ sơ dự án trình Bộ GTVT trước ngày 25-11-2020 để thẩm định phê duyệt dự án.
Ngày 16-12-2020, Bộ GTVT cũng có văn bản gửi Bộ Quốc phòng xem xét điều chỉnh đất quốc phòng liên quan đến công tác quy hoạch Cảng hàng không Côn Đảo.
Ngày 31-3-2021, Bộ GTVT tiếp tục có văn bản kiến nghị Bộ Quốc phòng sớm có ý kiến thống nhất về quy hoạch và diện tích đất quốc phòng để làm cơ sở phê duyệt dự án. Hiện dự án đã được Thủ tướng Chính phủ đồng ý bố trí trong kế hoạch đầu tư công trung hạn.