Cụ thể, UBND TPHCM kiến nghị Bộ Nội vụ cho phép các địa phương quyết định việc xây dựng vị trí việc làm đặc thù, không có trong quy định của Trung ương phù hợp với chức năng, nhiệm vụ của các cơ quan, đơn vị; đảm bảo nguyên tắc phù hợp với chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ cấu tổ chức của các cơ quan, đơn vị. Việc xây dựng vị trí việc làm, xác định yêu cầu về khung năng lực của các vị trí việc làm đặc thù được thực hiện trên cơ sở chức năng, nhiệm vụ được giao, tiêu chuẩn chức danh nghề nghiệp của Bộ chuyên ngành.
Mặt khác, việc hướng dẫn cơ cấu viên chức theo chức danh nghề nghiệp của các bộ, ngành hiện nay không đồng bộ; một số bộ, ngành không hướng dẫn cụ thể cơ cấu mà ghi chung chung là thực hiện theo Nghị định 106/2020. Vì vậy, UBND TPHCM đề nghị Bộ Nội vụ thống nhất hướng dẫn chung về cơ cấu viên chức theo hạng chức danh nghề nghiệp tại Luật Viên chức và các văn bản hướng dẫn thi hành để làm cơ sở triển khai thực hiện thống nhất toàn quốc.
Theo thống kê, đến nay, TPHCM đã phê duyệt vị trí việc làm của 21/22 quận, huyện, TP Thủ Đức (gồm 252 tổ chức hành chính). Đối với đơn vị sự nghiệp, TP đã đã phê duyệt vị trí việc làm của 8/33 đơn vị sự nghiệp công lập thuộc TPHCM và các sở, ban, ngành; 1.245/1.432 đơn vị sự nghiệp thuộc UBND quận, huyện, TP Thủ Đức. Các cơ quan, đơn vị còn lại đang trong giai đoạn thẩm định.
Theo UBND TPHCM, các bộ, ngành đã ban hành khung quy định về vị trí việc làm lãnh đạo, quản lý và chuyên môn nghiệp vụ tại đơn vị sự nghiệp công lập. Tuy nhiên, qua công tác xây dựng đề án vị trí việc làm thời gian qua theo chỉ đạo chung của Chính phủ, vị trí việc làm và cơ cấu viên chức theo chức danh nghề nghiệp còn có một số vướng mắc.
Cụ thể, danh mục vị trí việc làm do Trung ương ban hành còn chưa bao quát đầy đủ chức năng, nhiệm vụ của đơn vị sự nghiệp (chức năng, nhiệm vụ theo quy định chung, chưa tính các vị trí đặc thù), một số thông tư của bộ chuyên ngành quy định thiếu các vị trí lãnh đạo, quản lý tại đơn vị sự nghiệp thuộc địa phương.
Ngoài ra, từ việc phân cấp, phân quyền, nhiều cơ quan, đơn vị được giao các chức năng nhiệm vụ đặc thù. Một số cơ quan, đơn vị do sáp nhập, sắp xếp tổ chức bộ máy nên có thêm nhiều chức năng, nhiệm vụ riêng. Thực tế này làm phát sinh nhiều vị trí của công chức, viên chức chưa có trong quy định tại thông tư của các bộ, ngành nhưng thực sự cần thiết và phù hợp với chức năng, nhiệm vụ và tình hình thực tế của địa phương.