Qua kiểm tra, lực lượng chức năng tỉnh Phú Yên xác định Công ty Cổ phần Xây dựng hạ tầng Bắc Trung Nam khai thác có cao độ đáy sông thấp hơn mức sâu khai thác cho phép theo Bản xác nhận số 11/XN-UBND ngày 3-8-2023, với nội dung xác nhận khu vực, công suất, khối lượng, phương pháp, thiết bị, kế hoạch và bảo vệ môi trường trong khai thác khoáng sản vật liệu xây dựng thông thường cung cấp cho dự án thành phần đoạn Quy Nhơn - Chí Thạnh thuộc công trình đường bộ cao tốc Bắc - Nam (tại mỏ cát vật liệu xây dựng thông thường sông Cái, thôn Mỹ Long, xã An Dân, huyện Tuy An, tỉnh Phú Yên).
Tại thời điểm ngày 21-6-2024, các cơ quan chức năng xác định cao độ đáy sông thấp hơn mức sâu khai thác cho phép từ 0,01m - 0,439m, trung bình là 0,17m. Diện tích tại vị trí có độ sâu vượt 0,439m khoảng 100m2 trên tổng diện tích là 0,55ha…
Với những sai phạm trên, UBND tỉnh Phú Yên quyết định xử phạt Công ty Cổ phần Xây dựng hạ tầng Bắc Trung Nam số tiền 120 triệu đồng. Ngoài ra, buộc doanh nghiệp này phải cải tạo, phục hồi môi trường; thực hiện các giải pháp đưa các khu vực đã khai thác vượt độ sâu ra ngoài phạm vi được phép khai thác về trạng thái an toàn…
Để phục vụ thi công cao tốc Bắc - Nam, UBND tỉnh Phú Yên đã cấp 16 bản xác nhận khai thác vật liệu xây dựng thông thường. Đến nay, các nhà thầu khai thác được 16/16 điểm mỏ (5 mỏ cát, 11 mỏ đất), đáp ứng nhu cầu về vật liệu cho dự án. Đối với Dự án thành phần Quy Nhơn - Chí Thạnh đã khai thác 2 mỏ cát, 1 mỏ đất (điều phối giữa các dự án thành phần). Đối với Dự án Chí Thạnh - Vân Phong đã khai thác 4 khu vực đăng ký trên tuyến và 3 mỏ cát, 6 mỏ đất (theo cơ chế đặc thù).