Tờ Tempo dẫn lời Tham mưu trưởng Hải quân Indonesia, Đô đốc Yudo Margono, cho biết, cuộc điều tra về nguyên nhân tàu ngầm nói trên bị chìm chỉ có thể được tiến hành sau khi xác tàu ngầm được trục vớt thành công và đưa vào đất liền.
Đây không phải là nhiệm vụ dễ dàng do độ sâu của xác tàu đắm gây rủi ro rất cao cho nhóm tìm kiếm. Tuy nhiên, ông Yudo đảm bảo rằng, tàu KRI Nanggala 402 không bị chìm do lỗi của con người vì các quy trình chính xác đã được tuân thủ.
Trong khi đó, thành viên Ủy ban I (giám sát đối ngoại, tình báo và quân sự) thuộc Hạ viện Indonesia, ông TB Hasanuddin, nghi ngờ rằng tàu ngầm KRI Nanggala 402 bị chìm do sai sót trong quá trình sửa chữa và nâng cấp vào năm 2012.
