Theo đó, sau khi đại hội bầu và công bố kết quả bầu ban chấp hành Đảng bộ khóa mới, đoàn chủ tịch đại hội lấy ý kiến (bằng phiếu) đại biểu dự đại hội để giới thiệu nhân sự bí thư cấp ủy. Người được giới thiệu phải nằm trong ban chấp hành Đảng bộ khóa mới vừa trúng cử.
Kế đến, cấp ủy khóa mới họp, tiếp thu ý kiến của cấp ủy cấp trên trực tiếp về phương án nhân sự bí thư cấp ủy, nghiên cứu danh sách cán bộ được quy hoạch vào chức danh bí thư cấp ủy và nghiên cứu kết quả giới thiệu nhân sự bí thư của đại biểu, từ đó giới thiệu bí thư cấp ủy (bằng phiếu kín). Sau đó, cấp ủy viên khóa mới trở về các đoàn đại biểu (tổ thảo luận) để thực hiện quyền ứng cử, đề cử chức danh bí thư cấp ủy tại đoàn đại biểu (tổ thảo luận).
Đoàn chủ tịch sẽ tập hợp danh sách ứng cử, đề cử và thông báo với cấp ủy khóa mới. Trường hợp danh sách ứng cử, đề cử chức danh bí thư cấp ủy của đại hội đúng phương án nhân sự (đã được cấp ủy cấp trên trực tiếp đồng ý), hoặc trên 50% đại biểu (đảng viên) được triệu tập dự đại hội đề cử khác phương án nhân sự đã được cấp ủy cấp trên trực tiếp đồng ý, nhưng nhân sự này có trong quy hoạch chức danh bí thư cấp ủy khóa mới thì đoàn chủ tịch điều hành để đại hội bầu bí thư cấp ủy (mà không phải báo cáo, xin lại ý kiến của cấp ủy cấp trên trực tiếp).
Trường hợp trên 50% đại biểu được triệu tập dự đại hội đề cử nhân sự khác phương án nhân sự đã được cấp ủy cấp trên trực tiếp đồng ý; đồng thời nhân sự này không có trong quy hoạch chức danh bí thư cấp ủy khóa mới thì cấp ủy khóa mới thảo luận và biểu quyết (bằng phiếu kín) về nhân sự này.
Nếu trên 50% cấp ủy viên khóa mới nhất trí với phương án nhân sự được đa số đại biểu đại hội giới thiệu, thì đại hội tiến hành bầu cử (không phải xin ý kiến của cấp ủy cấp trên trực tiếp). Nếu trên 50% cấp ủy viên khóa mới không nhất trí với phương án nhân sự được đa số đại biểu giới thiệu, thì cấp ủy khóa mới phải báo cáo, xin ý kiến chỉ đạo của cấp ủy cấp trên trực tiếp.
Theo Ban Tổ chức Thành ủy, danh sách bầu cử bí thư cấp ủy có thể có số dư hoặc không có số dư. Tuy nhiên, nếu đại hội bầu lần thứ nhất không có ai trúng cử chức danh bí thư cấp ủy thì cần thảo luận kỹ trước khi bầu lần thứ hai. Nếu bầu lần thứ hai vẫn không có ai trúng cử, thì việc đại hội có bầu tiếp hay giao lại cho ban chấp hành Đảng bộ khóa mới bầu bí thư cấp ủy (theo quy định của Điều lệ Đảng và Quy chế bầu cử trong Đảng) là do đại hội quyết định.
Đảng bộ cơ sở có cấp ủy đoàn kết, thống nhất cao sẽ được tổ chức bầu trực tiếp bí thư. Nhân sự dự kiến giới thiệu ứng cử chức danh bí thư cấp ủy phải là người tiêu biểu, hội tụ đủ phẩm chất, năng lực, uy tín, có khả năng đáp ứng tốt yêu cầu, nhiệm vụ và hoàn thành tốt nhiệm vụ được giao.
Việc đại hội bầu trực tiếp bí thư cấp ủy nhằm tiếp tục mở rộng dân chủ trong Đảng, phát huy quyền dân chủ trực tiếp của đại biểu (đảng viên) dự đại hội Đảng bộ; đồng thời chống các biểu hiện dân chủ hình thức, dân chủ cực đoan, tư tưởng cục bộ, bè phái, mất đoàn kết.