Theo cáo trạng năm 2016, Bệnh viện Tim Hà Nội tổ chức đấu thầu rộng rãi để mua sắm hóa chất, vật tư, thiết bị y tế phục vụ khám chữa bệnh cho cả năm 2016.
Cuối năm 2015, ông Nguyễn Quang Tuấn ký quyết định phê duyệt danh mục mua hóa chất, vật tư năm 2016 gồm 807 mặt hàng, theo đơn giá phê duyệt với tổng số tiền hơn 396 tỷ đồng, trong đó có vật tư của 2 doanh nghiệp là Công ty Hoàng Nga, Công ty Kim Hòa Phát.
Ông Nguyễn Quang Tuấn chỉ đạo 2 doanh nghiệp trên ký gửi vật tư y tế để Bệnh viện Tim Hà Nội sử dụng trước, sau đó hợp thức, hoàn thiện các thủ tục đấu thầu rộng rãi, chỉ định thầu rút gọn để ký quyết định phê duyệt cho 2 doanh nghiệp trên trúng gói thầu năm 2016.
Trong quá trình thực hiện đấu thầu, ông Nguyễn Quang Tuấn đã chỉ đạo cấp dưới và ngay cả bản thân ông đã có hành vi chỉnh sửa công văn sử dụng chứng thư thẩm định để tạo điều kiện cho doanh nghiệp trúng thầu. Hành vi của ông Nguyễn Quang Tuấn lợi dụng chức vụ, quyền hạn can thiệp bất hợp pháp vào hoạt động đấu thầu, gây thiệt hại cho Bệnh viện Tim Hà Nội, quỹ bảo hiểm xã hội hơn 53 tỷ đồng.
Tại cơ quan điều tra, ông Nguyễn Quang Tuấn còn khai đã nhận 10.000 USD “quà cảm ơn” từ Nguyễn Đức Đảng, Chủ tịch HĐQT Công ty Hoàng Nga, vì đã tạo điều kiện cho doanh nghiệp này trúng thầu.
