Các bị cáo đưa ra xét xử gồm: Nguyễn Đức Chung (sinh năm 1967, cựu Chủ tịch UBND TP Hà Nội); Phạm Quang Dũng (sinh năm 1983, cựu cán bộ Cục Cảnh sát điều tra tội phạm về tham nhũng, kinh tế, buôn lậu, Bộ Công an); Nguyễn Hoàng Trung (sinh năm 1983, cựu chuyên viên, Phòng Thư ký - Biên tập, Văn phòng UBND TP Hà Nội); Nguyễn Anh Ngọc (sinh năm 1974, cựu Phó trưởng Phòng Thư ký - Biên tập, Văn phòng UBND TP Hà Nội). Vụ án được xét xử kín.
Theo cáo trạng, ông Nguyễn Đức Chung có vai trò chủ mưu trong vụ án chiếm đoạt tài liệu mật liên quan đến vụ án Công ty Nhật Cường. Trong vụ án, cơ quan tố tụng xác định, bị cáo Phạm Quang Dũng 5 lần thu thập 9 tài liệu thuộc danh mục bí mật nhà nước độ “Mật” liên quan đến vụ án Công ty Nhật Cường. Bị cáo Dũng đã gửi tổng cộng 6 tài liệu “Mật” cho ông Nguyễn Đức Chung. Đây là vụ án được dư luận đặc biệt quan tâm bởi tính chất và mức độ nghiêm trọng của vụ việc.