Năm 2020, Tổng cục Hải quan được Quốc hội và Bộ Tài chính giao dự toán thu là 338.000 tỷ đồng.
Với sự nỗ lực của toàn ngành, đến hết ngày 31-12-2020, số thu ngân sách nhà nước đạt khoảng 315.000 tỷ đồng, bằng 93,2% dự toán (338.000 tỷ đồng), đạt 105% số đã báo cáo Quốc hội tại kỳ họp thứ 10 khóa XIV (300.000 tỷ đồng).
Cơ quan hải quan khởi tố 37 vụ án hình sự, chuyển cơ quan khác kiến nghị khởi tố 130 vụ, số tiền thu nộp ngân sách nhà nước 463,191 tỷ đồng.
Trong đó, nổi bật là triệt phá thành công chuyên án buôn lậu thuốc lá điếu trên biển lớn nhất từ trước tới nay, thu giữ khoảng 8.549 kiện, tương đương 4.274.500 bao thuốc lá điếu các loại bao gồm thuốc lá ba số 555, Essi, Yuxi, Double…
Kết quả kiểm tra các đối tượng trên tàu đã sang mạn trót lọt xuống 5 xuồng cao tốc khoảng 2.000 kiện thuốc lá, tương đương 1.000.000 bao, số lượng thuốc lá còn lại trên tàu khoảng 6.549 kiện, tương đương 3.274.500 bao thuốc lá điếu các loại.
Vụ thứ hai, tập trung đấu tranh hoạt động buôn lậu mặt hàng dược liệu. Cụ thể, Cục Điều tra chống buôn lậu – Tổng cục Hải quan đã phối hợp với Cục Hải quan TP Đà Nẵng, cơ quan kiểm nghiệm thuốc thuộc Bộ Y tế và các cơ quan chức năng khác trên địa bàn tiến hành khám xét 5 container, phát hiện hàng hóa bên trong không phải chỉ là táo ta, củ cải, cà rốt như doanh nghiệp khai báo mà phần lớn là thảo dược, khối lượng khoảng 103 tấn.
Tính đến tháng 11 năm 2020, lực lượng hải quan cũng đã chủ trì, phối hợp với các lực lượng chức năng tổ chức triệt phá thành công nhiều chuyên án lớn liên quan đến vận chuyển trái phép chất ma túy qua biên giới, phát hiện 205 vụ, bắt giữ 184 đối tượng; thu giữ hơn 82 kg và 219 bánh heroin; 16,02kg cần sa; 15,7kg thuốc phiện; 23,01kg và 412.464 viên ma túy tổng hợp; 646,6kg ma túy đá...
Nhiều chuyên án ma tuý có công đầu là của lực lượng hải quan tại các cửa khẩu, phát hiện ma tuý thông qua hệ thống soi chiếu để lực lượng liên ngành vào cuộc điều tra, bắt giữ.