Vụ án này có 38 bị cáo, trong đó cựu Bộ trưởng Bộ Y tế Nguyễn Thanh Long bị truy tố tội “Nhận hối lộ”; cựu Bộ trưởng Bộ KH-CN Chu Ngọc Anh bị truy tố tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí”; cựu Bí thư Tỉnh ủy Hải Dương Phạm Xuân Thăng truy tố tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”; Tổng Giám đốc Công ty Việt Á Phan Quốc Việt bị truy tố tội “Đưa hối lộ” và “Vi phạm quy định đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”.
Viện Kiểm sát nhân dân tối cao cáo buộc, khi dịch Covid-19 bùng phát, Chính phủ và Bộ KH-CN giao các đơn vị khoa học chủ động nghiên cứu chế tạo sinh phẩm phục vụ công tác phòng, chống dịch. Phan Quốc Việt đã thông đồng với Trịnh Thanh Hùng (cựu Phó Vụ trưởng Vụ KH-CN các ngành kinh tế - kỹ thuật thuộc Bộ KH-CN) để Công ty Việt Á được phê duyệt tham gia, phối hợp Học viện Quân y thực hiện đề tài. Sau khi kit test được cấp số đăng ký lưu hành tạm thời và đăng ký lưu hành chính thức, Phan Quốc Việt đã nâng khống cơ cấu đơn giá.
Kết quả điều tra xác định, trong năm 2020 và 2021, tổng doanh thu của Công ty Việt Á là hơn 4.247 tỷ đồng. Trong đó, Công ty Việt Á đã sản xuất tổng hơn 8,7 triệu kit test, đã tiêu thụ cho các đơn vị, cơ sở y tế là hơn 8,3 triệu kit test với tổng giá trị hơn 3.929 tỷ đồng (với đơn giá 470.000 đồng/kit test).
Đã được thanh toán hơn 5,9 triệu kit test với tổng giá trị 2.257 tỷ đồng. Bên cạnh đó, cơ quan tố tụng xác định Phan Quốc Việt đưa hối lộ với tổng số tiền 3 triệu USD và 4 tỷ đồng.