Cụ thể, năm 2012 và 2014, Hà Tĩnh chi 350 triệu đồng mua sắm phương tiện, thiết bị, vật tư phục vụ khám chữa bệnh; năm 2015 chi 100 triệu đồng mua vật tư, tu sửa nhà làm việc, nhà nghỉ cho bệnh nhân; từ đầu năm 2016, khi Trung tâm Phục hồi chức năng và dưỡng sinh Võ Hoàng Yên ngừng hoạt động, Hà Tĩnh chi 56 triệu đồng để thuê người bảo vệ và quản lý tài sản trung tâm. Số kinh phí trên không chi trực tiếp cho ông Võ Hoàng Yên mà hỗ trợ trung tâm và được cấp dự toán qua Hội Đông y tỉnh, được Kho bạc tỉnh kiểm soát các khoản chi.
Trước đó, năm 2011, ông Võ Hoàng Yên từng được cấp một khu đất trống, với diện tích hơn 64.000m2 ở thôn Mỹ Sơn (xã Cẩm Mỹ, huyện Cẩm Xuyên, tỉnh Hà Tĩnh) để xây dựng Trung tâm Phục hồi chức năng, dưỡng sinh và trồng cây thuốc nam chữa bệnh. Tuy nhiên, sau đó dự án không được triển khai xây dựng, bỏ hoang đất đai lãng phí nên UBND huyện Cẩm Xuyên đã thu hồi.
Đến năm 2014, tỉnh Hà Tĩnh cho phép sử dụng cơ sở vật chất Trường THCS xã Cẩm Vịnh, huyện Cẩm Xuyên (trường đang bỏ không sau khi sáp nhập vào Trường THCS Cẩm Thành) để làm Trung tâm Phục hồi chức năng và dưỡng sinh Võ Hoàng Yên, với diện tích gần 2ha. Trung tâm hoạt động đến đầu năm 2016 thì ngưng và bàn giao cho tỉnh Hà Tĩnh quản lý.