Hiện nay, một số di tích trong quần thể di tích quốc gia đặc biệt Côn Đảo bị hư hỏng, xuống cấp nghiêm trọng. Tại các trại Phú Thọ, Phú Sơn, Phú Tường, Phú An, Phú Bình, Sở Lò Vôi, Nhà Chúa đảo, nền nhà bị bong rộp, tường đổ sập, mái nhà hư hỏng, cửa và song sắt bị gỉ sét do nhiều tác động.
Dự án có các hạng mục phục chế, tu sửa các vị trí bị xuống cấp, tháo dỡ các công trình không thuộc phạm vi di tích và phục dựng các hạng mục theo hình ảnh tư liệu lịch sử nhằm phát huy tối đa các giá trị của các di tích. Ngoài ra, sẽ cải tạo hệ thống mương thoát nước, hệ thống cây xanh, chống sét, chiếu sáng sự cố và chỉ dẫn thoát nạn tại một số di tích trong quần thể. Dự án được giao cho Sở VH-TT tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu làm chủ đầu tư với thời gian thực hiện trong vòng 4 năm.