Tại khu đô thị mới An Phú Thịnh (khu B), chủ đầu tư đang triển khai san nền đạt 92%. Quá trình thi công, doanh nghiệp mở 2 đường công vụ tạm có bề rộng 4m, lấp dòng chảy phía dưới có bố trí cống để thoát nước. Tại thời điểm kiểm tra, chủ đầu tư chưa thực hiện cắm mốc ranh giới quy hoạch ra ngoài thực địa. Qua đó, đoàn kiểm tra đề nghị doanh nghiệp tháo dỡ 2 đường công vụ tạm trước 31-8-2021 để khơi thông dòng chảy, đảm bảo thoát lũ trong mùa mưa bão sắp tới; thực hiện cắm mốc ranh giới quy hoạch ra ngoài thực địa.
Còn dự án Khu du lịch, sinh thái và biệt thự đầm Thị Nại (khu A2) đến nay doanh nghiệp vẫn chưa có giấy phép xây dựng. Tại vị trí quy hoạch dự án đang có một bãi tập kết cát đã san lấp rất nhiều diện tích rừng cây ngập mặn để làm nền dự án. Đoàn thanh tra liên ngành đề nghị Công ty CP Thị Nại Eco Bay không được phép thi công xây dựng bất cứ hạng mục nào của dự án khi chưa có giấy phép xây dựng; khu vực tập kết cát phải đảm bảo nằm trong ranh giới quy hoạch của dự án, không được làm ảnh hưởng đến các dòng thoát lũ sông Hà Thanh.