Theo đó, trạm thu phí Tân Phú trên quốc lộ (QL) 20 (huyện Tân Phú), trạm thu phí cầu Đồng Nai trên QL 1A và trạm thu phí QL 1K (TP Biên Hòa) do Tổng cục Đường bộ quản lý đã dừng hoạt động từ năm 2020. Hiện các trạm thu phí không được duy tu, bảo dưỡng nên xuống cấp, hệ thống đèn báo không còn hoạt động, tiềm ẩn nguy cơ gây mất an toàn giao thông.
Đồng Nai hiện còn 3 trạm thu phí BOT đang hoạt động (không tính cao tốc TPHCM - Long Thành - Dầu Giây) là BOT QL 51, thu phí cho dự án đầu tư mở rộng QL 51; BOT Trảng Bom trên QL 1A thu phí dự án cải tạo QL 1A qua huyện Trảng Bom dài 10km, tuyến tránh TP Biên Hòa dài hơn 12km (đường Võ Nguyên Giáp) và BOT tỉnh lộ 768 (nối huyện Vĩnh Cửu với TP Biên Hòa).