TP Thủ Đức cũng đề nghị số lượng cấp phó các cơ quan chuyên môn (13 cơ quan) bình quân là 4 người tại mỗi cơ quan. Căn cứ yêu cầu nhiệm vụ của từng đơn vị, UBND TP Thủ Đức đề xuất Ban Thường vụ Thành ủy TP Thủ Đức quyết định cụ thể số lượng phó trưởng phòng của từng phòng chuyên môn cho phù hợp.
Đồng thời, đề xuất số lượng biên chế công chức, viên chức được sử dụng đến năm 2026 tại TP Thủ Đức là 3/4 số lượng biên chế tại thời điểm sáp nhập 3 quận (quận 2, 9 và Thủ Đức). TP Thủ Đức đề nghị UBND TPHCM kiến nghị Chính phủ điều chỉnh quy định về số lượng cán bộ, công chức và người hoạt động không chuyên trách ở phường theo hướng xem xét đến quy mô dân số để bố trí biên chế phù hợp thực tiễn, đảm bảo công tác quản lý nhà nước ở địa phương.