Theo đó, đại diện VKS đề nghị phạt bị cáo Dương Văn Hòa (cựu Hiệu trưởng Trường Đại học Đông Đô) từ 12-13 năm tù giam, bồi thường 50 triệu đồng; Trần Kim Oanh (cựu Phó Hiệu trưởng, kiêm Phó Viện trưởng Viện Đào tạo liên tục Trường Đại học Đông Đô) từ 9-10 năm tù, bồi thường 20 triệu đồng; Lê Ngọc Hà (cựu Phó Hiệu trưởng, kiêm Phó Viện trưởng Viện 4.0, Trưởng ban In bằng Trường Đại học Đông Đô) từ 9-10 năm tù, bồi thường 10 triệu đồng.
Các bị cáo Trần Ngọc Quang (cựu Phó Trưởng Phòng Đào tạo và quản lý sinh viên) từ 8-9 năm tù, truy thu bị cáo 347 triệu đồng; Nguyễn Thị Huệ (cựu Trưởng phòng Tài vụ) từ 6-7 năm tù; Phạm Vân Thùy (cựu nhân viên Viện Đào tạo liên tục) từ 3-4 năm tù; Nguyễn Thị Ngọc Thái (cựu nhân viên Viện Đào tạo liên tục) và Lê Thị Thanh Tâm (cựu nhân viên Viện 4.0) cùng bị đề nghị từ 30-36 tháng tù, cho hưởng án treo; bị cáo Lê Thị Lương (cựu nhân viên Viện 4.0) và Ngô Quang Hiển (cựu nhân viên Viện Đào tạo liên tục) từ 12-18 tháng tù, cho hưởng án treo.
Cơ quan công tố xác định Trần Khắc Hùng là chủ mưu, chỉ đạo các bị cáo khác thực hiện hành vi. Bị cáo Dương Văn Hòa, Trần Kim Oanh và những người khác là người làm công ăn lương, làm theo chỉ đạo của Hùng.