Nguyên nhân chính là sự chậm trễ trong việc thực hiện đấu thầu thuốc tập trung cấp quốc gia. Cụ thể, ngày 22-5-2018, Trung tâm Mua sắm tập trung thuốc quốc gia có công văn số 106 về việc hướng dẫn xây dựng, tổng hợp nhu cầu thuốc đấu thầu tập trung cấp quốc gia năm 2018.
Theo công văn này, trung tâm dự kiến tổ chức và công bố kết quả lựa chọn nhà thầu cung ứng thuốc trước ngày 31-12-2018. Tuy nhiên, đến ngày 14-2-2019, trung tâm mới có quyết định phê duyệt kết quả lựa chọn nhà thầu gói thầu số 1 (cung cấp thuốc biệt dược gốc hoặc tương đương điều trị năm 2019-2020 cho các cơ sở y tế trên toàn quốc).
Tới ngày 23-4-2019, trung tâm mới có quyết định phê duyệt kết quả lựa chọn nhà thầu gói thầu số 2 (cung cấp thuốc generic năm 2019-2020) và gói thầu số 5 (cung cấp thuốc generic năm 2019-2020 cho các tỉnh miền Bắc).
Ngay sau đó, các BV đã liên hệ với đơn vị trúng thầu để được cung cấp một số loại thuốc. Tuy nhiên, các đơn vị trúng thầu lại chưa thể cung ứng ngay được.
Đại diện một số BV cho biết, với mặt hàng thuốc chứa hoạt chất Pemetrexed, do chưa có thuốc trúng thầu, các BV đã liên lạc với nhà thầu là Liên danh Codupha - An Thiên (trúng thầu mặt hàng Pemehope 100mg) và Công ty TNHH Dược phẩm và Trang thiết bị y tế Hoàng Đức (trúng thầu mặt hàng Podoxred 500mg) để lên kế hoạch nhập hàng, thì các nhà thầu thông báo chỉ có thể cung ứng hàng sau 2-4 tháng nữa.