Quyết định nêu rõ: giao các đại học, học viện, các trường đại học, các trường cao đẳng có nhóm ngành đào tạo giáo viên phối hợp với các cơ sở GD-ĐT tổ chức kỳ thi THPT quốc gia theo đúng quy định của Quy chế thi THPT quốc gia và xét công nhận tốt nghiệp THPT hiện hành.
Tại mỗi cụm thi, Bộ GD-ĐT cũng quy định rõ các đơn vị chủ trì chấm môn thi trắc nghiệm. Riêng ở Bạc Liêu, do ghép sở nên Bộ GD-ĐT giao Sở GD-ĐT và Sở KHCN chủ trì cụm thi đã quy định. Đáng lưu ý, trong văn bản Bộ GD-ĐT ban hành, cụm thi 50 tại tỉnh Đồng Nai lại do Sở GD-ĐT Tây Ninh chủ trì. Bộ GD-ĐT yêu cầu các sở GD-ĐT chủ trì cụm thi phối hợp với các trường có tên trong danh sách, tổ chức in sao đề thi, coi thi, chấm thi, thông báo kết quả thi, phúc khảo, xét công nhận tốt nghiệp THPT và báo cáo kết quả thi, kết quả xét công nhận tốt nghiệp THPT về Bộ GD-ĐT theo quy định của Quy chế thi THPT quốc gia và xét công nhận tốt nghiệp THPT.
Kỳ thi THPT quốc gia 2019, cả nước có 63 cụm thi. Để ngăn chặn nâng điểm thi như năm 2018, Bộ GD-ĐT đã quy định rõ các đơn vị - trường đại học chấm thi trắc nghiệm. Khác với năm trước, năm nay việc chấm thi trắc nghiệm hoàn toàn do các trường đại học đảm nhận. TPHCM thuộc cụm thi thứ 2, do Sở GD-ĐT TPHCM chủ trì tổ chức thi. Trường đại học chủ trì chấm thi trắc nghiệm tại cụm thi TPHCM là Đại học Quốc gia TPHCM (gồm Trường Đại học Bách khoa, Trường Kinh tế-Luật, Khoa học tự nhiên).