Theo hồ sơ truy tố, từ năm 2017 đến 2020, bà Lan có thỏa thuận mua cổ phần một số dự án của ông Trí tại Công ty cổ phần Cao su Công nghiệp Đồng Nai, Công ty cổ phần Đầu tư du lịch Sài Gòn Đại Ninh và thỏa thuận hợp tác đầu tư dự án tại huyện Hải Hà, tỉnh Quảng Ninh. Trong thời gian này, bà Lan đã nhiều lần chuyển tiền cho ông Trí qua Hồ Quốc Minh (người môi giới được bà Lan nhờ đứng tên) và các nhân viên của bà Lan để thanh toán theo thỏa thuận.
Cơ quan công tố làm rõ, trong việc thỏa thuận mua bán cổ phần với Công ty cổ phần Cao su Công nghiệp Đồng Nai, ông Trí chuyển nhượng 65% vốn điều lệ cho bà Lan với giá 45 triệu USD. Bà Lan đã chuyển cho ông Trí 3 lần tiền, tổng số 21,25 triệu USD. Do chưa chuyển nhượng trong vòng 5 năm kể từ ngày phát hành lần đầu cổ phiếu và đưa lên sàn chứng khoán nên ông Trí chỉ đạo các cá nhân đứng tên hộ ký hợp đồng ủy thác nhận ủy thác đầu tư với Hồ Quốc Minh tổng số hơn 5,4 triệu cổ phần Công ty cổ phần Cao su Công nghiệp Đồng Nai. Ông Trí và bà Lan sau đó thống nhất chuyển số tiền 21,25 triệu USD thành mua 10% vốn điều lệ Công ty cổ phần Đầu tư và Quản lý giáo dục Văn Lang.
Việc thỏa thuận mua bán cổ phần tại Công ty cổ phần Đầu tư du lịch Sài Gòn Đại Ninh được ông Trí và một người khác cùng thỏa thuận bán 100% vốn điều lệ cho công ty con của ông Trí. Sau đó, ông Trí thỏa thuận bán cho bà Lan 100% vốn điều lệ Công ty cổ phần Đầu tư du lịch Sài Gòn Đại Ninh với giá 3.000 tỷ đồng. Bà Lan đã đặt cọc cho ông Trí 1 triệu USD và 127 tỷ đồng. Sau đó, bà Lan và ông Trí thống nhất chuyển số tiền đặt cọc trên sang thanh toán mua 10% vốn điều lệ Công ty cổ phần Đầu tư và Quản lý giáo dục Văn Lang.
Bên cạnh đó, khoảng giữa năm 2020, doanh nghiệp của ông Trí được UBND tỉnh Quảng Ninh chấp thuận chủ trương để triển khai nghiên cứu quy hoạch và hướng dẫn một số thủ tục đầu tư vào dự án tại huyện Hải Hà.
Để tham gia vào dự án, bà Lan đã thỏa thuận thanh toán theo tiến độ phát sinh chi phí và 2 lần chuyển tiền cho ông Trí tổng cộng 9,5 triệu USD (khoảng hơn 220 tỷ đồng). Bà Lan sau đó không tham gia dự án và thống nhất với ông Trí chuyển số tiền 9,5 triệu USD để thanh toán mua 10% vốn điều lệ Công ty cổ phần Đầu tư và Quản lý giáo dục Văn Lang.
Cơ quan công tố cho hay, do nhận nhiều khoản tiền của bà Lan nhưng không có giấy tờ biên nhận nên đến tháng 1-2021, ông Trí đã gặp bà Lan để thống nhất các khoản mà bà Lan đã chuyển, tổng cộng là 1.000 tỷ đồng. Ông Trí sau đó đã chỉ đạo kế toán (là những người đứng tên cổ phần hộ ông Trí) ký giấy đề nghị chuyển nhượng cổ phần (không ghi số) và hợp đồng chuyển nhượng cổ phần cho Hồ Quốc Minh, tổng hơn 1.000 tỷ đồng. Cùng với đó, ông Trí ký giấy chứng nhận cho Hồ Quốc Minh sở hữu 10% vốn điều lệ tại Công ty cổ phần Đầu tư và Quản lý giáo dục Văn Lang.
Sau khi bà Lan bị khởi tố, bắt tạm giam về tội “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản” (ngày 7-10-2022), đến ngày 21 và 22-10-2022, ông Trí đã chỉ đạo trợ lý của mình là Bùi Anh Tuấn soạn thảo các văn bản điều chỉnh và thanh lý hợp đồng chuyển nhượng 10% vốn điều lệ tại Công ty cổ phần Đầu tư và Quản lý giáo dục Văn Lang và thanh lý hợp đồng ủy thác đầu tư hơn 31% vốn điều lệ tại Công ty cổ phần Cao su công nghiệp Đồng Nai.
Chỉ đạo thực hiện xong, ông Trí hẹn gặp Hồ Quốc Minh yêu cầu ký hồ sơ thanh lý hợp đồng đã soạn thảo sẵn, sau đó ông Trí đưa cho các cá nhân đứng tên hộ ký hợp thức, hoàn thiện thủ tục thanh lý. “Việc ông Trí tự ý lập các bản thanh lý hợp đồng với ông Minh là người đứng tên sở hữu cổ phần giúp bà Lan trị giá 1.000 tỷ đồng không được sự đồng ý của bà Lan”, cáo trạng ghi.
Làm việc với cơ quan điều tra, ông Trí không thừa nhận đã nhận tiền của bà Lan mà khai việc mình gặp ông Minh để yêu cầu ký thanh lý hợp đồng là tình cờ; không giao giấy tờ, tài liệu cho ông Minh ký. Viện Khoa học hình sự (Bộ Công an) đã có kết luận giám định chữ viết của ông Trí trong các tài liệu do ông này lập để theo dõi, xác nhận số tiền đã nhận của bà Lan, nhưng ông Trí vẫn không thừa nhận và cho rằng bà Lan vu khống, bôi nhọ danh dự của mình.
Về nội dung này, bà Trương Mỹ Lan đã có đơn yêu cầu làm rõ, xử lý hành vi của ông Trí chiếm đoạt tài sản của mình và thu hồi số tiền 1.000 tỷ đồng. Căn cứ tài liệu, chứng cứ, kết luận giám định, lời khai bị can và các cá nhân liên quan, có đủ cơ sở xác định: Lợi dụng việc bà Lan bị bắt, ông Trí đã có thủ đoạn gian dối, chỉ đạo nhân viên lập, hoàn thiện hồ sơ thanh lý hợp đồng chuyển nhượng, thanh lý hợp đồng ủy thác đầu tư để xóa bỏ nghĩa vụ nợ, nhằm chiếm đoạt số tiền 1.000 tỷ đồng đã nhận của bà Lan. Đến này ông trí đã nộp khắc phục trên 650 tỷ đồng và hơn 3.300 USD.
