Theo HĐXX, bị cáo Nguyễn Thị Thanh Nhàn (cựu Chủ tịch AIC) và bị cáo Dương Hoa Xô (cựu Giám đốc Trung tâm CNSH TPHCM) đã thống nhất thông thầu, dẫn đến không có tính cạnh tranh trong đấu thầu. Hành vi này tạo điều kiện cho AIC tiếp cận, trúng 8 gói thầu, đồng thời nâng khống 40% giá trị gói thầu thuộc dự án mua sắm trang thiết bị 12 phòng thí nghiệm tại Trung tâm CNSH TPHCM, gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 94,6 tỷ đồng.
HĐXX tuyên phạt bị cáo Nguyễn Thị Thanh Nhàn (xét xử vắng mặt) 24 năm tù về 2 tội "Đưa hối lộ" và "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng". Tổng hợp hình phạt ở 2 bản án trước, buộc bị cáo Nhàn phải chấp hành hình phạt chung là 30 năm tù.
HĐXX tuyên phạt bị cáo Trần Mạnh Hà (cựu Phó Tổng Giám đốc AIC, xét xử vắng mặt) 19 năm tù, tổng hợp hình phạt ở các bản án trước, buộc bị cáo chấp hành chung 30 năm tù; tuyên phạt bị cáo Trần Đăng Tấn (cựu Trưởng Văn phòng đại diện AIC tại TPHCM, xét xử vắng mặt) 18 năm tù; tuyên phạt bị cáo Đỗ Vân Trường (cựu Tổng Giám đốc Công ty CP Mopha thuộc hệ sinh thái AIC, xét xử vắng mặt) 4 năm tù.
Nhận hối lộ 14,4 tỷ đồng từ AIC, bị cáo Dương Hoa Xô bị tuyên phạt 15 năm tù.
HĐXX tuyên phạt bị cáo Trần Thị Bình Minh (cựu Phó Giám đốc Sở KH-ĐT TPHCM) mức án 7 năm 6 tháng tù; Phan Tất Thắng (cựu Phó trưởng Phòng Kinh tế ngành, Sở KH-ĐT TPHCM) 4 năm 6 tháng tù, cùng về tội "Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
Về trách nhiệm dân sự, HĐXX buộc bị cáo Nguyễn Thị Thanh Nhàn và AIC cùng liên đới theo phần bằng nhau bồi thường 94,6 tỷ đồng cho Trung tâm Công nghệ sinh học TPHCM. HĐXX cũng tuyên tịch thu toàn bộ số tiền các bị cáo, người liên quan thu lợi bất chính, nộp vào ngân sách nhà nước.
7 bị cáo còn lại phạm tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng", HĐXX tuyên phạt:
Bị cáo Nguyễn Đăng Quân (cựu Giám đốc Trung tâm CNSH TPHCM, chủ tịch hội đồng khoa học) 8 năm tù.
Bị cáo Nguyễn Viết Thạch (cựu Trưởng ban Quản lý đầu tư xây dựng công trình thuộc Trung tâm CNSH TPHCM) 5 năm tù.
Bị cáo Nguyễn Trần Long (cựu chuyên viên Ban Quản lý đầu tư xây dựng công trình thuộc Trung tâm CNSH TPHCM) 4 năm tù.
Bị cáo Trần Vinh Vũ (cựu Giám đốc Công ty Hồng Hà) 3 năm 6 tháng tù.
Bị cáo Nguyễn Minh (cựu Phó tổng giám đốc Công ty TNHH kiểm toán và dịch vụ tin học TPHCM - AISC) 4 năm tù.
Bị cáo Hồ Tấn Mạnh (cựu Tổng giám đốc Công ty thẩm định giá SEAAC) 4 năm tù.
Bị cáo Huỳnh Tấn Vĩnh (cựu Giám đốc Công ty CP tư vấn Nguyên Châu) 3 năm 6 tháng tù.