Trong phiên xử có 4 bị cáo đã bỏ trốn và bị xét xử vắng mặt. Đó là, Nguyễn Thị Thanh Nhàn, Chủ tịch HĐQT kiêm Tổng giám đốc Công ty AIC, bị đề nghị mức án từ 22-24 năm tù về các tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng" và "Đưa hối lộ". Tổng hợp hình phạt đối với 2 bản án trước đó, buộc bị cáo Nhàn chấp hành chung hình phạt 30 năm tù. Bị cáo Trần Mạnh Hà, Phó Tổng giám đốc Công ty AIC, từ 19-21 năm tù. Bị cáo Trần Đăng Tấn, Trưởng Văn phòng đại diện Công ty AIC tại TPHCM, từ 18-20 năm tù về các tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng" và "Đưa hối lộ". Bị cáo Đỗ Vân Trường, Tổng Giám đốc Công ty Cổ phần Mopha, 4-5 năm tù về tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng".
Bị cáo Dương Hoa Xô, cựu Giám đốc Trung tâm CNSH TPHCM, từ 15-16 năm tù về tội "Nhận hối lộ". Bị cáo Trần Thị Bình Minh, cựu Phó Giám đốc Sở KH-ĐT TPHCM, 8-9 năm tù và Phan Tất Thắng, cựu Phó trưởng Phòng Kinh tế ngành, Sở KH-ĐT TPHCM, 5-6 năm tù về tội "Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
7 bị cáo còn lại trong vụ án từ 4-9 năm tù về tội vi phạm quy định đấu thầu, gây hậu quả nghiêm trọng.
Theo đại diện Viện KSND, tháng 4-2014, bị cáo Nhàn biết Trung tâm CNSH đang triển khai dự án 12 phòng thí nghiệm nên đã làm quen với bị cáo Xô và đặt vấn đề tham gia dự án và chi tiền cảm ơn.
Sau khi Dương Hoa Xô "bật đèn xanh", Nguyễn Thị Thanh Nhàn chỉ đạo cấp dưới đến gặp, bàn bạc, thống nhất với ông Xô về việc Công ty AIC sẽ xây dựng danh mục thiết bị, nhằm bảo đảm cho doanh nghiệp này hưởng lợi nhuận tương đương khoảng 40% giá trị mỗi gói thầu.
Không chỉ thông đồng với các bị cáo thuộc chủ đầu tư, AIC còn được các đơn vị tư vấn và thẩm định giá tiếp tay. Khi thẩm định giá, nhân viên công ty thẩm định không làm việc độc lập, không khảo sát thị trường, không kiểm chứng thông tin báo giá.
Nhóm này sử dụng danh mục và đơn giá do Trung tâm CNSH cung cấp (đã móc nối với AIC) để phát hành chứng thư thẩm định giá. Các chứng thư trái quy định được sử dụng, đưa vào hồ sơ làm căn cứ thẩm định giá, giúp Nguyễn Thị Thanh Nhàn cùng đồng phạm nâng khống giá các thiết bị đấu thầu.
Công ty AIC và các công ty liên quan đã "thâu tóm" 8/10 gói thầu, gây thiệt hại hơn 94 tỷ đồng.
Đại diện Viện KSND ghi nhận, các bị cáo thành khẩn khai báo, tích cực hợp tác với cơ quan tố tụng. Một số bị cáo vận động gia đình nộp lại tiền khắc phục hậu quả. Một số bị cáo thuộc gia đình có công cách mạng, cha mẹ là liệt sĩ, được tặng nhiều huân huy chương.... Do đó, đại diện Viện KSND đề nghị HĐXX xem xét giảm nhẹ một phần hình phạt khi lượng hình.
