Trong tổng số 13 bị can bị đề nghị truy tố, bị can Đinh Minh Hiệp (cựu Giám đốc Sở NN-PTNT TPHCM) bị cáo buộc vi phạm tội danh “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng” quy định tại Khoản 3 Điều 222 Bộ luật Hình sự. Tại điều khoản này, người phạm tội gây thiệt hại 1 tỷ đồng trở lên thì bị phạt tù từ 10 năm đến 20 năm.
Theo hồ sơ điều tra, giữa năm 2016, bị can Hoàng Minh Bá (Giám đốc Công ty T.S.T) biết về dự án Nấm và nhờ Phạm Nguyễn Đức Hoàng (nhân viên Trung tâm Công nghệ sinh học TPHCM) kết nối để gặp bị can Đinh Minh Hiệp (thời điểm đang là Trưởng Ban Quản lý Khu nông nghiệp). Tại phòng làm việc của bị can Hiệp, bị can Bá đã đề nghị và được bị can Hiệp cho Công ty T.S.T tham gia cung cấp thiết bị cho dự án Nấm. Sau khi đồng ý, bị can Hiệp yêu cầu doanh nghiệp phải cung cấp thiết bị hiện đại và nhiều tiêu chí khác.
Theo kết luận điều tra, quá trình thực hiện đầu tư, bị can Bá căn cứ vào danh mục do bị can Hiệp dự thảo và gửi cho các hãng cung cấp thiết bị lên danh mục để hoàn chỉnh hồ sơ dự thầu với giá dự toán hơn 86 tỷ đồng. Bên cạnh đó, khi xây dựng danh mục trang thiết bị chi tiết, bị can Bá còn giới thiệu đơn vị tư vấn lập dự án gồm Công ty PVE Hà Nội và Công ty SIV làm đơn vị tư vấn thẩm định giá. Toàn bộ thủ tục để chỉ định thầu đều do cấp dưới soạn thảo để trình bị can Đinh Minh Hiệp ký.
Kết luận điều tra cũng cáo buộc, cựu Giám đốc Sở NN-PTNT TPHCM Đinh Minh Hiệp đã thỏa thuận, thống nhất với Hoàng Minh Bá để cho Công ty T.S.T tham gia dự án Nấm ngay từ giai đoạn chuẩn bị đầu tư. Sau đó, bị can Hiệp chỉ đạo cấp dưới hợp thức hóa danh mục thiết bị mua sắm với tổng trị giá hơn 86 tỷ đồng, qua đó tạo điều kiện cho Công ty T.S.T trúng thầu với các thông số hồ sơ đã được chuẩn hóa, hợp thức từ trước. Đấu thầu xong, bị can Đinh Minh Hiệp được Hoàng Minh Bá đưa số tiền 1 tỷ đồng vào các dịp Tết Nguyên đán năm 2019 và 2020.
Cơ quan Cảnh sát điều tra cáo buộc, bị can Đinh Minh Hiệp gây thiệt hại cho Nhà nước số tiền hơn 33 tỷ đồng. Trong giai đoạn điều tra, bị can Đinh Minh Hiệp đã nộp khắc phục 400 triệu đồng. Còn bị can Hoàng Minh Bá nộp khắc phục 1,15 tỷ đồng.
Tại cơ quan điều tra, bị can Đinh Minh Hiệp khai nhận rõ hành vi phạm tội. Ngay từ giai đoạn xin chủ trương đầu tư, triển khai các bước tư vấn để phê duyệt dự án trên, bị can Hiệp đã thông đồng với Hoàng Minh Bá để xây dựng danh mục trang thiết bị hoàn chỉnh chi tiết bao gồm cả giá đầu ra của dự án. Bị can Hiệp chỉ đạo Phạm Tấn Kiên (cựu Phó Chánh Văn phòng Sở NN-PTNT TPHCM) sử dụng danh mục này hợp thức hóa các bước tư vấn và triển khai trình Sở KH-ĐT phê duyệt dự án, phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu, phê duyệt dự toán và triển khai đấu thầu, tạo điều kiện cho Công ty T.S.T của bị can Bá dự thầu và trúng thầu theo đúng danh mục trang thiết bị.
